RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431405.1

USP9YP31-201, Transcript of USP9Y pseudogene 31, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP31, Length 881 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP31-201ENST00000431405 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.74□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.74□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.74□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.74□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.74□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.74□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 GIPRP48546 466 aa6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 PDE4BQ07343 736 aa6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 C1QL4Q86Z23 238 aa6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 NCANO14594 1321 aa6.73□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 SCRIBQ14160 1630 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 ETFBP38117 255 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 TMEM87BQ96K49 555 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 DRC1Q96MC2 740 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 USP35Q9P2H5 1018 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 KLHL3Q9UH77 587 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP31-201ENST00000431405 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 LEFTY1O75610 366 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 TSPAN15O95858 294 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 ATP2B1P20020 1258 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 HID1Q8IV36 788 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 FBXO41Q8TF61 875 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 GMIPQ9P107 970 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 NCAPD3P42695 1498 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 PRRG2O14669 202 aa6.7□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 IMPDH2P12268 514 aa6.7□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.7□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 ATG4CQ96DT6 458 aa6.7□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 TOX2Q96NM4 488 aa6.7□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 ACRP10323 421 aa6.69□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 CFPP27918 469 aa6.69□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 CAP2P40123 477 aa6.69□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 ARSHQ5FYA8 562 aa6.69□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.69□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.69□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 FAM13CQ8NE31 585 aa6.69□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.69□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 SMARCA2P51531 1590 aa6.69□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 RAP1GAPP47736 663 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 KCNMB1Q16558 191 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 SLC6A19Q695T7 634 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 KCT2Q8NC54 265 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 XAGE3Q8WTP9 111 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 SLC9A7Q96T83 725 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 LRIG2O94898 1065 aa6.67□□□□□ -1.34
USP9YP31-201ENST00000431405 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms