RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 GABPAQ06546 454 aa22.21■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 COG2Q14746 738 aa22.21■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANO1Q5XXA6 986 aa22.21■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.21■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.21■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.21■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.21■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.21■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 LTBP2Q14767 1821 aa22.2■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 RLFQ13129 1914 aa22.2■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 KBTBD13C9JR72 458 aa22.2■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 STRNO43815 780 aa22.2■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 EVX2Q03828 476 aa22.2■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.2■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 CEP85Q6P2H3 762 aa22.2■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 GUCD1Q96NT3 240 aa22.2■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 EYSQ5T1H1 3165 aa22.2■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 IGHA2P01877 340 aa22.19■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 PDE6AP16499 860 aa22.19■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 ERCC3P19447 782 aa22.19■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 PLS1Q14651 629 aa22.19■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.19■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.18■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.18■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.18■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.17■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 VCANP13611 3396 aa22.17■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.17■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 SEPT4O43236 478 aa22.17■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.17■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 MB21D1Q8N884 522 aa22.17■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.17■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.17■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.17■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYH8P13535 1937 aa22.17■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.16■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 COBLO75128 1261 aa22.16■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 CYP2D6P10635 497 aa22.16■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIM60Q495X7 471 aa22.16■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.16■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.16■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.16■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 FLOT1O75955 427 aa22.15■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 DSG3P32926 999 aa22.15■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 SHHQ15465 462 aa22.15■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.15■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.15■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.15■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 LCORLQ8N3X6 602 aa22.15■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATG4CQ96DT6 458 aa22.15■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 MROH8Q9H579 483 aa22.15■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.15■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
UPK3BP1-201ENST00000428678 GOLIM4O00461 696 aa22.14■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.14■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.14■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.14■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 FERMT2Q96AC1 680 aa22.14■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.14■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 BCL11AQ9H165 835 aa22.14■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 SWAP70Q9UH65 585 aa22.14■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 APBB1O00213 710 aa22.13■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 ICA1Q05084 483 aa22.13■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 LRRC41Q15345 812 aa22.13■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.13■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.13■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 BADQ92934 168 aa22.13■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAML3Q96JK9 1138 aa22.13■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 SH2D4AQ9H788 454 aa22.13■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.13■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.12■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 FCER1AP12319 257 aa22.12■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 AKR1B1P15121 316 aa22.12■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 SNX17Q15036 470 aa22.12■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.12■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARMT1Q9H993 441 aa22.12■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.12■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMX2Q9Y320 296 aa22.12■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 CDH23Q9H251 3354 aa22.12■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 VCPKMTQ9H867 229 aa22.11■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 PARP14Q460N5 1801 aa22.1■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.1■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.1■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 TTC28Q96AY4 2481 aa22.1■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.09■■□□□ 1.13
UPK3BP1-201ENST00000428678 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms