RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 ANKS1AQ92625 1134 aa28.3■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 DDX11Q96FC9 970 aa28.3■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 DEFB129Q9H1M3 183 aa28.3■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 GDF11O95390 407 aa28.3■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 TROAPQ12815 778 aa28.3■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.3■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa28.3■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 GLTPD2A6NH11 291 aa28.29■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 TMEM47Q9BQJ4 181 aa28.29■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 PRDM10Q9NQV6 1147 aa28.29■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 NID2Q14112 1375 aa28.29■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 PTPDC1A2A3K4 754 aa28.28■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 ZNF710Q8N1W2 664 aa28.28■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 CATIPQ7Z7H3 387 aa28.28■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 SPTLC3Q9NUV7 552 aa28.28■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 MTMR4Q9NYA4 1195 aa28.28■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 MYH4Q9Y623 1939 aa28.27■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 NOVP48745 357 aa28.27■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa28.27■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 FANCBQ8NB91 859 aa28.27■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 PNMA1Q8ND90 353 aa28.27■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 CHMP4CQ96CF2 233 aa28.27■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 CCDC17Q96LX7 622 aa28.27■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 KAT14Q9H8E8 782 aa28.27■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 NTRK3Q16288 839 aa28.27■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 CCDC178Q5BJE1 867 aa28.27■■■□□ 2.12
CTU1-201ENST00000421832 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 RTN1Q16799 776 aa28.26■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 RASGRP2Q7LDG7 609 aa28.26■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 FDPSP14324 419 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 GUCY1A2P33402 732 aa28.25■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 TAOK2Q9UL54 1235 aa28.25■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 CPLX1O14810 134 aa28.25■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 RCAN1P53805 252 aa28.25■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 MTMR7Q9Y216 660 aa28.25■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 KIF3AQ9Y496 699 aa28.25■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 TBC1D12O60347 775 aa28.24■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 DDAH1O94760 285 aa28.24■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 SYT1P21579 422 aa28.24■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 SEPT2Q15019 361 aa28.24■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 ABCB5Q2M3G0 1257 aa28.24■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 PHKBQ93100 1093 aa28.24■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 BRD1O95696 1058 aa28.23■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 MAP3K10Q02779 954 aa28.23■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 DLK2Q6UY11 383 aa28.23■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 POTECB2RU33 542 aa28.23■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 GH2P01242 217 aa28.23■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 SCN4AP35499 1836 aa28.23■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 CCDC82Q8N4S0 544 aa28.22■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 CLIP2Q9UDT6 1046 aa28.22■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 UBE2Q2LH0YL09 131 aa28.22■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 TOP1P11387 765 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 EPHX2P34913 555 aa28.22■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 TAF3Q5VWG9 929 aa28.22■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 PLEKHA8P1O95397 391 aa28.21■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 SIAH1Q8IUQ4 282 aa28.21■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 TTLL1O95922 423 aa28.2■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 ATP2B2Q01814 1243 aa28.2■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 TMEM179Q6ZVK1 233 aa28.2■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 ATAD5Q96QE3 1844 aa28.2■■■□□ 2.11
CTU1-201ENST00000421832 WDR90Q96KV7 1748 aa28.2■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 CALM1P0DP23 149 aa28.2■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 CALM2P0DP24 149 aa28.2■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 CALM3P0DP25 149 aa28.2■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 FOSBP53539 338 aa28.2■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 RNF214Q8ND24 703 aa28.2■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 FZD1Q9UP38 647 aa28.2■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa28.19■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 MYH6P13533 1939 aa28.19■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 PHF20L1A8MW92 1017 aa28.19■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 ARID3AQ99856 593 aa28.19■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 STX6O43752 255 aa28.19■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 EEF2P13639 858 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 IFNAR1P17181 557 aa28.19■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 NBPF11Q86T75 865 aa28.19■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 STAG2Q8N3U4 1231 aa28.19■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 FUT2Q10981 343 aa28.18■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CTU1-201ENST00000421832 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
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