RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 DEXIO95424 95 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC192P0DO97 292 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 PLCD1P51178 756 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 ANO1Q5XXA6 986 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 FSIP1Q8NA03 581 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 MASTLQ96GX5 879 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1B0GVL5 298 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 BTBD18B2RXH4 712 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 PLEKHA8P1O95397 391 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 TROAPQ12815 778 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 NBPF11Q86T75 865 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 C2CD5Q86YS7 1000 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC44A5Q8NCS7 719 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 PIBF1Q8WXW3 757 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R9BQ96SB3 815 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 FUCA2Q9BTY2 467 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 MXD3Q9BW11 206 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CLSTN2Q9H4D0 955 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 PLSCR2Q9NRY7 297 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 POLR3EQ9NVU0 708 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 MTMR7Q9Y216 660 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 V9GY48 417 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 STK36Q9NRP7 1315 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 KINO60870 393 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 YEATS4O95619 227 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 RCAN1P53805 252 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 PRSS12P56730 875 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 TYRO3Q06418 890 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP2R5BQ15173 497 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC15A2Q16348 729 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 ADALQ6DHV7 355 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SLF2Q8IX21 1173 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNG4Q8TDN1 519 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 ARID3AQ99856 593 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 COA1Q9GZY4 146 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 TIAM2Q8IVF5 1701 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L3A6NCW0 530 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L4A6NCW7 530 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 H0YIN7 160 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 IGSF3O75054 1194 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 MMP1P03956 469 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPY3P0CV98 308 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPY8P0CW00 308 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CALM1P0DP23 149 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CALM2P0DP24 149 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CALM3P0DP25 149 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP2B1P20020 1258 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CHRNA5P30532 468 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 NR5A1Q13285 461 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 PICALMQ13492 652 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SASS6Q6UVJ0 657 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 USP17L1Q7RTZ2 530 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 DBNDD1Q9H9R9 158 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 USP25Q9UHP3 1055 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM205AQ6ZU69 1335 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 MYH2Q9UKX2 1941 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SCNN1DP51172 638 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 RHBDL3P58872 404 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM160A1Q05DH4 1040 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC39A14Q15043 492 aa4.59□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 RCSD1Q6JBY9 416 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 SDF4Q9BRK5 362 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 KAT14Q9H8E8 782 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 IL17RBQ9NRM6 502 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 STK32BQ9NY57 414 aa4.59□□□□□ -1.67
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LRRTM4-201ENST00000409088 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 NID2Q14112 1375 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRTM4-201ENST00000409088 CHD4Q14839 1912 aa4.59□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 DDAH1O94760 285 aa4.59□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 XBP1P17861 261 aa4.59□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFA8P51970 172 aa4.59□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 FUT2Q10981 343 aa4.59□□□□□ -1.68
LRRTM4-201ENST00000409088 PKN1Q16512 942 aa4.59□□□□□ -1.68
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