RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 DLK2Q6UY11 383 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 CPVLQ9H3G5 476 aa23.43■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 USP17L5A8MUK1 530 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 H3BQV1 296 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 IFFO2Q5TF58 517 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.42■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 TBC1D12O60347 775 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 ALG1Q9BT22 464 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 FZD1Q9UP38 647 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 MCM4P33991 863 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 PPP2R5BQ15173 497 aa23.41■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 MAP3K10Q02779 954 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 ICA1Q05084 483 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 C8orf76Q96K31 380 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 KIF3AQ9Y496 699 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 STK36Q9NRP7 1315 aa23.4■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 PDHBP11177 359 aa23.39■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.39■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 KIF5BP33176 963 aa23.39■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 PKN1Q16512 942 aa23.39■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.39■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 SHISA4Q96DD7 197 aa23.39■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 GBP4Q96PP9 640 aa23.39■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 MAP3K14Q99558 947 aa23.39■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 GLTPD2A6NH11 291 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 CYTH3O43739 400 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 MCTP1Q6DN14 999 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.38■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 A0A1W2PRG0 241 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 CABP5Q9NP86 173 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 RAD21O60216 631 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 CAP2P40123 477 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 RESTQ13127 1097 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 NYAP2Q9P242 653 aa23.37■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 KLRF2D3W0D1 207 aa23.36■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 DEXIO95424 95 aa23.36■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 ECE1P42892 770 aa23.36■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.36■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 SNHG28P0DPA3 235 aa23.35■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 KRT40Q6A162 431 aa23.35■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 ACER1Q8TDN7 264 aa23.35■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 MKL1Q969V6 931 aa23.35■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.35■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 POTECB2RU33 542 aa23.35■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 EPHX2P34913 555 aa23.35■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.35■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.35■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 ADM5C9JUS6 153 aa23.34■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.34■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.34■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 KIF28PB7ZC32 967 aa23.33■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 INPP5BP32019 993 aa23.33■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.33■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 KCTD1Q719H9 257 aa23.33■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.33■■□□□ 1.33
ODC1-202ENST00000405333 ZNF543Q08ER8 600 aa23.32■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.32■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 WASF1Q92558 559 aa23.32■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.32■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.32■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 GNAQP50148 359 aa23.31■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.31■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.31■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 F5H6K3 240 aa23.31■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 SCN4AP35499 1836 aa23.31■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 SLC16A2P36021 539 aa23.31■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 KLRC3Q07444 240 aa23.31■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 PRKG1Q13976 671 aa23.31■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 CCDC96Q2M329 555 aa23.31■■□□□ 1.32
ODC1-202ENST00000405333 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms