RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403807.3

VPREB1-202, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VPREB1, Length 755 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1-202ENST00000403807 IQCA1Q86XH1 822 aa16.16■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 NCOA7Q8NI08 942 aa16.16■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 LPAR1Q92633 364 aa16.16■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 TTC14Q96N46 770 aa16.16■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa16.16■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 STX8Q9UNK0 236 aa16.16■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 MYH8P13535 1937 aa16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 USP17L15C9J2P7 530 aa16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 USP17L13C9JLJ4 530 aa16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 USP17L11C9JVI0 530 aa16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 USP17L18D6R9N7 530 aa16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 USP17L22D6RA61 530 aa16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 USP17L17D6RBQ6 530 aa16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 USP17L19D6RCP7 530 aa16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 USP17L20D6RJB6 530 aa16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 RAD21O60216 631 aa16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 TLR2O60603 784 aa16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 USP17L24Q0WX57 530 aa16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 ZSWIM5Q9P217 1185 aa16.15■□□□□ 0.18
VPREB1-202ENST00000403807 F5H6K3 240 aa16.14■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 GPR25O00155 361 aa16.14■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 NMT2O60551 498 aa16.14■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 CYP2C8P10632 490 aa16.14■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 VCAM1P19320 739 aa16.14■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 NOVP48745 357 aa16.14■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 KLRC3Q07444 240 aa16.14■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa16.14■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa16.14■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 PCNTO95613 3336 aa16.14■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 WDR46O15213 610 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 DGKHQ86XP1 1220 aa16.13■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.13■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa16.13■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 TOP1P11387 765 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 TSGA10IPQ3SY00 556 aa16.12■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa16.12■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa16.12■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.12■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 TMEM47Q9BQJ4 181 aa16.12■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 UBAC1Q9BSL1 405 aa16.12■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 HOXC10Q9NYD6 342 aa16.12■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 TAF6LQ9Y6J9 622 aa16.12■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 ERICH2A1L162 156 aa16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 FKTNO75072 461 aa16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 HSPA4P34932 840 aa16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 SP3Q02447 781 aa16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 KRT32Q14532 448 aa16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 COG2Q14746 738 aa16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 SART3Q15020 963 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 SLFN13Q68D06 897 aa16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 C17orf99Q6UX52 265 aa16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 STOX1Q6ZVD7 989 aa16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 ANKS1AQ92625 1134 aa16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 USP26Q9BXU7 913 aa16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 TANGO6Q9C0B7 1094 aa16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 CPA4Q9UI42 421 aa16.11■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 NDUFB10O96000 172 aa16.1■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 MCCP23508 829 aa16.1■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 HERVK_113P62684 666 aa16.1■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 RCSD1Q6JBY9 416 aa16.1■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 CYB5R4Q7L1T6 521 aa16.1■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 PTPRFP10586 1907 aa16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 FLOT1O75955 427 aa16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 BMP3P12645 472 aa16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 MCM5P33992 734 aa16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 SLC1A4P43007 532 aa16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 KIF22Q14807 665 aa16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 FAM83BQ5T0W9 1011 aa16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 RASEFQ8IZ41 740 aa16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 KCNB2Q92953 911 aa16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 NEK1Q96PY6 1258 aa16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 MTA3Q9BTC8 594 aa16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 KAT14Q9H8E8 782 aa16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 LAMA4Q16363 1823 aa16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 TNKSO95271 1327 aa16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 ADGRA2Q96PE1 1338 aa16.09■□□□□ 0.17
VPREB1-202ENST00000403807 BCRP11274 1271 aa16.08■□□□□ 0.16
VPREB1-202ENST00000403807 DSG3P32926 999 aa16.08■□□□□ 0.16
VPREB1-202ENST00000403807 ARHGEF6Q15052 776 aa16.08■□□□□ 0.16
VPREB1-202ENST00000403807 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
VPREB1-202ENST00000403807 LBX2Q6XYB7 198 aa16.08■□□□□ 0.16
VPREB1-202ENST00000403807 CHST3Q7LGC8 479 aa16.08■□□□□ 0.16
VPREB1-202ENST00000403807 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80 ms