RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 ALX1Q15699 326 aa32.36■■■□□ 2.77
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GNPTAB-202ENST00000392919 INHAP05111 366 aa32.35■■■□□ 2.77
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GNPTAB-202ENST00000392919 CDK8P49336 464 aa32.34■■■□□ 2.77
GNPTAB-202ENST00000392919 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa32.34■■■□□ 2.77
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GNPTAB-202ENST00000392919 PLXNB2O15031 1838 aa32.34■■■□□ 2.77
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GNPTAB-202ENST00000392919 USP17L18D6R9N7 530 aa32.32■■■□□ 2.76
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GNPTAB-202ENST00000392919 USP17L20D6RJB6 530 aa32.32■■■□□ 2.76
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GNPTAB-202ENST00000392919 AKR1B1P15121 316 aa32.31■■■□□ 2.76
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GNPTAB-202ENST00000392919 RAD50Q92878 1312 aa32.3■■■□□ 2.76
GNPTAB-202ENST00000392919 PPARAQ07869 468 aa32.3■■■□□ 2.76
GNPTAB-202ENST00000392919 STK11IPQ8N1F8 1099 aa32.3■■■□□ 2.76
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GNPTAB-202ENST00000392919 NKX2-3Q8TAU0 364 aa32.29■■■□□ 2.76
GNPTAB-202ENST00000392919 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
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GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM179Q6ZVK1 233 aa32.28■■■□□ 2.76
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GNPTAB-202ENST00000392919 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
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GNPTAB-202ENST00000392919 DSCC1Q9BVC3 393 aa32.26■■■□□ 2.75
GNPTAB-202ENST00000392919 ANAPC4Q9UJX5 808 aa32.26■■■□□ 2.75
GNPTAB-202ENST00000392919 SGPL1O95470 568 aa32.25■■■□□ 2.75
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GNPTAB-202ENST00000392919 BTBD7Q9P203 1132 aa32.24■■■□□ 2.75
GNPTAB-202ENST00000392919 TACC3Q9Y6A5 838 aa32.24■■■□□ 2.75
GNPTAB-202ENST00000392919 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
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GNPTAB-202ENST00000392919 HMGCRP04035 888 aa32.23■■■□□ 2.75
GNPTAB-202ENST00000392919 NUDT12Q9BQG2 462 aa32.23■■■□□ 2.75
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GNPTAB-202ENST00000392919 LBX2Q6XYB7 198 aa32.22■■■□□ 2.75
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GNPTAB-202ENST00000392919 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP32.22■■■□□ 2.75
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GNPTAB-202ENST00000392919 PLEKHH3Q7Z736 793 aa32.21■■■□□ 2.75
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GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF287Q9HBT7 754 aa32.21■■■□□ 2.75
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GNPTAB-202ENST00000392919 SOCS4Q8WXH5 440 aa32.2■■■□□ 2.75
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GNPTAB-202ENST00000392919 RLFQ13129 1914 aa32.2■■■□□ 2.74
GNPTAB-202ENST00000392919 CDC45O75419 566 aa32.19■■■□□ 2.74
GNPTAB-202ENST00000392919 SPICE1Q8N0Z3 855 aa32.19■■■□□ 2.74
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GNPTAB-202ENST00000392919 NBPF3Q9H094 633 aa32.19■■■□□ 2.74
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa32.19■■■□□ 2.74
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GNPTAB-202ENST00000392919 CCL14Q16627 93 aa32.18■■■□□ 2.74
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
GNPTAB-202ENST00000392919 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
GNPTAB-202ENST00000392919 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
GNPTAB-202ENST00000392919 EEF2P13639 858 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
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