RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 APBA3O96018 575 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 CUL4AQ13619 759 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 DOK7Q18PE1 504 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM76AQ8TAV0 307 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM31Q9BZY9 425 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 GINS2Q9Y248 185 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 PTGDRQ13258 359 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 MSL1Q68DK7 614 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 RDH13Q8NBN7 331 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 CALRP27797 417 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 ALDH1B1P30837 517 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 TPH2Q8IWU9 490 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 KIFC2Q96AC6 838 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNK9Q9NPC2 374 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 NLRP1Q9C000 1473 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 PPIP5K2O43314 1243 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 TYW1BQ6NUM6 668 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 IFT74Q96LB3 600 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 OSBP2Q969R2 916 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP19.15■□□□□ 0.662e-7■■□□□ 12.9
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 M0R2C6 588 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 TMOD4Q9NZQ9 345 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 CEP104O60308 925 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 BTDP43251 543 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 C2CD5Q86YS7 1000 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 MSANTD4Q8NCY6 345 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 KIFAP3Q92845 792 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa19.14■□□□□ 0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 MED23Q9ULK4 1368 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF804BA4D1E1 1349 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A087WWV3 80 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 PSTPIP2Q9H939 334 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 STX10O60499 249 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBTB16Q05516 673 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 OR8K1Q8NGG5 319 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHA12Q9UN75 941 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 LARGE1O95461 756 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 HPDP32754 393 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 TUBB2AQ13885 445 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 TUBB2BQ9BVA1 445 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 SERPINA10Q9UK55 444 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNJ18B7U540 433 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 PRKAB2O43741 272 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNJ12Q14500 433 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 RTEL1Q9NZ71 1219 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 OTUD6BQ8N6M0 293 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 NT5C3AQ9H0P0 336 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR17Q8IZU2 1322 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP2B4P23634 1241 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 KLHL7Q8IXQ5 586 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC63Q8NA47 563 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 PPARDQ03181 441 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 PRR16Q569H4 304 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 MORC3Q14149 939 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC39A14Q15043 492 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 NEK8Q86SG6 692 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 NLRP10Q86W26 655 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 MICALL1Q8N3F8 863 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM182BQ5T319 152 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 SFMBT2Q5VUG0 894 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKS4BQ8N8V4 417 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 OR52Z1P0C646 297 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 STRN3Q13033 797 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 GPBP1Q86WP2 473 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 PI4K2BQ8TCG2 481 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 EXOC7Q9UPT5 735 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 GAS7O60861 476 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGAP44Q17R89 818 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC121Q6ZUS5 278 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP19.11■□□□□ 0.652e-6■■■□□ 16
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBED4O75132 1171 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 ADD2P35612 726 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 POLA2Q14181 598 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 C6orf163Q5TEZ5 329 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 MXRA7P84157 204 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 TTC14Q96N46 770 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PQ27 194 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PQ64 194 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PQD8 194 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 FLOT1O75955 427 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 MYOCDQ8IZQ8 938 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP4-202ENST00000392011 CARMIL3Q8ND23 1372 aa19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms