RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 TMX2Q9Y320 296 aa28.16■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 MINDY4BA8MYZ0 360 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM32Q13049 653 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 PLEKHH3Q7Z736 793 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 SOCS4Q8WXH5 440 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 TRIB2Q92519 343 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 DEFB118Q96PH6 123 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 STAP2Q9UGK3 403 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 GNAT2P19087 354 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 COG2Q14746 738 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 TICAM2Q86XR7 235 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 USP6NLQ92738 828 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 TANGO6Q9C0B7 1094 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-201ENST00000378543 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 CCNA1P78396 465 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 MORN1Q5T089 497 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.093e-6■■■■□ 26.6
FAAP20-201ENST00000378543 SH2D4AQ9H788 454 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 VCPKMTQ9H867 229 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 EEF2P13639 858 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 SPICE1Q8N0Z3 855 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 LPAR1Q92633 364 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 PARP14Q460N5 1801 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 ROBO3Q96MS0 1386 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 APPP05067 770 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 RASA1P20936 1047 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 TDO2P48775 406 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 ATP2B2Q01814 1243 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 KANSL2Q9H9L4 492 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 HOXC10Q9NYD6 342 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 A0A0G2JMZ2 1700 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 TFRCP02786 760 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 WDR78Q5VTH9 848 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 IFNL3Q8IZI9 196 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 MKNK2Q9HBH9 465 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 RPTORQ8N122 1335 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 RGS2P41220 211 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 PDE1AP54750 535 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 CCL14Q16627 93 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 PTPREP23469 700 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 DSG3P32926 999 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 MAP2K5Q13163 448 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-201ENST00000378543 WDR46O15213 610 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 FLOT1O75955 427 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 ATG4CQ96DT6 458 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 APBA2Q99767 749 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 SLC15A5A6NIM6 579 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 NUCB1Q02818 461 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 EVI5LQ96CN4 794 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 LNPKQ9C0E8 428 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 PRDM1O75626 825 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 IGHDP01880 384 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 CAPN2P17655 700 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 NACAP1Q9BZK3 213 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 SPATC1LQ9H0A9 340 aa28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 MYH4Q9Y623 1939 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 GRB14Q14449 540 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 MB21D1Q8N884 522 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 DPF3Q92784 378 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 NAPBQ9H115 298 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 GOPCQ9HD26 462 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 FBXO28Q9NVF7 368 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 RAD21O60216 631 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 HTATIP2Q9BUP3 242 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 OSBPL3Q9H4L5 887 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 NYAP2Q9P242 653 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 FOXP2O15409 715 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 NPLOC4Q8TAT6 608 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF287Q9HBT7 754 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 FLRT1Q9NZU1 646 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 CEP290O15078 2479 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-201ENST00000378543 H0YGN5 161 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 ERCC3P19447 782 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-201ENST00000378543 PLS1Q14651 629 aa28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.3 ms