RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369838.5

SH3BGRL2-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL2, Length 4,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 BICDL2A1A5D9 508 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GSDMDP57764 484 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 UBXN1Q04323 297 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 POLA2Q14181 598 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KIAA0753Q2KHM9 967 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HS1BP3Q53T59 392 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TTLL11Q8NHH1 800 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CCDC42Q96M95 316 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PLVAPQ9BX97 442 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ANO3Q9BYT9 981 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FAM170AA1A519 330 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CHRNA5P30532 468 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TERF1P54274 439 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLC8A3P57103 927 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CLEC4GQ6UXB4 293 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CCDC17Q96LX7 622 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CTAGE1Q96RT6 745 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LPXNO60711 386 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CAVIN2O95810 425 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MIER3Q7Z3K6 550 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RNF34Q969K3 372 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PRKAB2O43741 272 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 POLR2MP0CAP2 368 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLC16A2P36021 539 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PTH1RQ03431 593 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FANCBQ8NB91 859 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HAUS7Q99871 368 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DSCC1Q9BVC3 393 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 A0A0G2JLW4 131 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 EXOC3O60645 756 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KCTD1Q719H9 257 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MAP7D2Q96T17 732 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RTEL1Q9NZ71 1219 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TBC1D9BQ66K14 1250 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KCNH3Q9ULD8 1083 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 STX10O60499 249 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IREB2P48200 963 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 STAP2Q9UGK3 403 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.252e-6■□□□□ 8.8
SH3BGRL2-201ENST00000369838 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 OVOS2Q6IE36 1432 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 UQCRHLA0A096LP55 91 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 UQCRHP07919 91 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CYP4A11Q02928 519 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CUL4AQ13619 759 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 INF2Q27J81 1249 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CETN3O15182 167 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PPP2R5BQ15173 497 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 AOC3Q16853 763 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FAM200AQ8TCP9 573 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 EPB41P11171 864 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KRT9P35527 623 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CCDC50Q8IVM0 306 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GCNT3O95395 438 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HSPA4P34932 840 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 XKR9Q5GH70 373 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 C2orf69Q8N8R5 385 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DEPTORQ8TB45 409 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MSANTD4Q8NCY6 345 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DYNLL2Q96FJ2 89 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FAM196BA6NMK8 535 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NFIXQ14938 502 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 UBE3CQ15386 1083 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CCDC186Q7Z3E2 898 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 VPS16Q9H269 839 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PCDHA12Q9UN75 941 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NEMFO60524 1076 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TYRO3Q06418 890 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PLA2G4DQ86XP0 818 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 COA1Q9GZY4 146 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KANSL2Q9H9L4 492 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PI4KBQ9UBF8 816 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 POTEB2H3BUK9 544 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BGRL2-201ENST00000369838 USP31Q70CQ4 1352 aa13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms