RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.031e-7■■□□□ 13.5
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PTPRC-204ENST00000367379 LILRA2Q8N149 483 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-204ENST00000367379 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-204ENST00000367379 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-204ENST00000367379 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-204ENST00000367379 LRRN2O75325 713 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-204ENST00000367379 F13A1P00488 732 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-204ENST00000367379 NR0B2Q15466 257 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-204ENST00000367379 RHOVQ96L33 236 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-204ENST00000367379 NCAPD3P42695 1498 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRC-204ENST00000367379 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-204ENST00000367379 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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PTPRC-204ENST00000367379 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.58□□□□□ -1.04
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PTPRC-204ENST00000367379 LTKP29376 864 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 KCNN1Q92952 543 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 CRELD1Q96HD1 420 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 FAM161BQ96MY7 647 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 SHISA3A0PJX4 238 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 F6X3S4 739 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 HTR3BO95264 441 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 TEKQ02763 1124 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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PTPRC-204ENST00000367379 SMARCA2P51531 1590 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRC-204ENST00000367379 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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PTPRC-204ENST00000367379 LILRA6Q6PI73 481 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 MCOLN1Q9GZU1 580 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRC-204ENST00000367379 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.54□□□□□ -1.04
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PTPRC-204ENST00000367379 ERCC6Q03468 1493 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 PEX10O60683 326 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 GARTP22102 1010 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 CHRNEQ04844 493 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 SHISA4Q96DD7 197 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 KLHL3Q9UH77 587 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-204ENST00000367379 SMARCA4P51532 1647 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 GRIN3BO60391 1043 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 DUSP4Q13115 394 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 MPP2Q14168 576 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 REC114Q7Z4M0 266 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 RELL1Q8IUW5 271 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 HMGXB3Q12766 1538 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 SEMA7AO75326 666 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 DLG4P78352 724 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 PWP1Q13610 501 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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PTPRC-204ENST00000367379 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 CUX2O14529 1486 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 NOTOA8MTQ0 251 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 NUAK1O60285 661 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 SORBS3O60504 671 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 PSPNO60542 156 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF605Q86T29 641 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 FBXO27Q8NI29 283 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 KIF2CQ99661 725 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 RGS13O14921 159 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 INHBBP09529 407 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-204ENST00000367379 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.49□□□□□ -1.05
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