RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 PTPAQ15257 358 aa28.02■■■□□ 2.08
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa28.02■■■□□ 2.08
SERF1A-202ENST00000354833 NIM1KQ8IY84 436 aa28.02■■■□□ 2.08
SERF1A-202ENST00000354833 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
SERF1A-202ENST00000354833 PI4KBQ9UBF8 816 aa28.02■■■□□ 2.08
SERF1A-202ENST00000354833 KRT2P35908 639 aa28.01■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 MAP3K11Q16584 847 aa28.01■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 RILPL1Q5EBL4 403 aa28.01■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 FUCA2Q9BTY2 467 aa28.01■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 TNMDQ9H2S6 317 aa28.01■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 PPP6R2O75170 966 aa28■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 FSIP1Q8NA03 581 aa28■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 ENTPD3O75355 529 aa28■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 FAM160A1Q05DH4 1040 aa28■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 CAMK4Q16566 473 aa28■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa28■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 ENGASEQ8NFI3 743 aa28■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC17Q96LX7 622 aa28■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 SGIP1Q9BQI5 828 aa28■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 BRMS1Q9HCU9 246 aa28■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 HDAC9Q9UKV0 1011 aa28■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 MTMR7Q9Y216 660 aa28■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 JMYQ8N9B5 988 aa27.99■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 DNAJC18Q9H819 358 aa27.99■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 KLRF2D3W0D1 207 aa27.98■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 NPY5RQ15761 445 aa27.98■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 SLC35G1Q2M3R5 365 aa27.98■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 PIBF1Q8WXW3 757 aa27.98■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 CYTH3O43739 400 aa27.98■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 TTLL1O95922 423 aa27.98■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 SPZ1Q9BXG8 430 aa27.98■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 TAOK3Q9H2K8 898 aa27.98■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 SH3GLB2Q9NR46 395 aa27.98■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.98■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 ATRNL1Q5VV63 1379 aa27.97■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 SPDYE2BA6NHP3 402 aa27.97■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 SPDYE6P0CI01 402 aa27.97■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 OGFOD1Q8N543 542 aa27.97■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 MYH8P13535 1937 aa27.96■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 SIPA1L1O43166 1804 aa27.96■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 GOLGA8HP0CJ92 632 aa27.96■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 CABP5Q9NP86 173 aa27.96■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 SMARCA1P28370 1054 aa27.95■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 NLRP5P59047 1200 aa27.95■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 USP17L2Q6R6M4 530 aa27.95■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 RASGRP2Q7LDG7 609 aa27.95■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 AGBL3Q8NEM8 1001 aa27.95■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 TNFRSF25Q93038 417 aa27.95■■■□□ 2.07
SERF1A-202ENST00000354833 CMA1P23946 247 aa27.95■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 DLGAP5Q15398 846 aa27.95■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa27.95■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 CLIP2Q9UDT6 1046 aa27.95■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC192P0DO97 292 aa27.94■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 SLURP2P0DP57 97 aa27.94■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 PDHBP11177 359 aa27.94■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 RNF214Q8ND24 703 aa27.94■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 TRIM34Q9BYJ4 488 aa27.94■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 TMOD2Q9NZR1 351 aa27.94■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 A0A1B0GVL5 298 aa27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 USP17L5A8MUK1 530 aa27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 CTAGE5O15320 804 aa27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 KINO60870 393 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 CALML3P27482 149 aa27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 CXCL9Q07325 125 aa27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 TATDN1Q6P1N9 297 aa27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 CLEC10AQ8IUN9 316 aa27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 SNHG28P0DPA3 235 aa27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 NDUFA8P51970 172 aa27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 EIF6P56537 245 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 CKAP2LQ8IYA6 745 aa27.93■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 FAM196BA6NMK8 535 aa27.92■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SERF1A-202ENST00000354833 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms