RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342075.8

PMS1-201, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2

Gene PMS1, Length 3,012 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-201ENST00000342075 WDR90Q96KV7 1748 aa16.19■□□□□ 0.18
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PMS1-201ENST00000342075 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa16.19■□□□□ 0.18
PMS1-201ENST00000342075 SLC26A6Q9BXS9 759 aa16.19■□□□□ 0.18
PMS1-201ENST00000342075 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.19■□□□□ 0.18
PMS1-201ENST00000342075 MAD2L2Q9UI95 211 aa16.19■□□□□ 0.18
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PMS1-201ENST00000342075 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.19■□□□□ 0.18
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PMS1-201ENST00000342075 KCNJ14Q9UNX9 436 aa16.13■□□□□ 0.17
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PMS1-201ENST00000342075 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PMS1-201ENST00000342075 SMCHD1A6NHR9 2005 aa16.12■□□□□ 0.17
PMS1-201ENST00000342075 ASNSP08243 561 aa16.12■□□□□ 0.17
PMS1-201ENST00000342075 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PMS1-201ENST00000342075 DCAF15Q66K64 600 aa16.12■□□□□ 0.17
PMS1-201ENST00000342075 VPS54Q9P1Q0 977 aa16.12■□□□□ 0.17
PMS1-201ENST00000342075 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
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