RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336283.7

SRA1-201, Transcript of steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRA1, Length 2,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1-201ENST00000336283 CRY2Q49AN0 593 aa16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 NYAP1Q6ZVC0 841 aa16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 USP27XA6NNY8 438 aa16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 CTIFO43310 598 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 CALML3P27482 149 aa16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 GNAQP50148 359 aa16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 GPSM2P81274 684 aa16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 PTPN14Q15678 1187 aa16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 CEP135Q66GS9 1140 aa16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 MKNK2Q9HBH9 465 aa16.1■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 ST5P78524 1137 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 DIXDC1Q155Q3 683 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 GRIK5Q16478 980 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 CFAP100Q494V2 611 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 PNMA1Q8ND90 353 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 DPF2Q92785 391 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 DHX58Q96C10 678 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 DYNLL2Q96FJ2 89 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 EPSTI1Q96J88 318 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 WNT7AO00755 349 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 GRM4Q14833 912 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 SLC51AQ86UW1 340 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 VSTM4Q8IW00 320 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 PKNOX2Q96KN3 472 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 CD209Q9NNX6 404 aa16.09■□□□□ 0.17
SRA1-201ENST00000336283 A0A087X0B3 334 aa16.08■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 GYS1P13807 737 aa16.08■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 IL1R1P14778 569 aa16.08■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 ZNF18P17022 549 aa16.08■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 PTGDRQ13258 359 aa16.08■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa16.08■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TSC1Q92574 1164 aa16.08■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 PAGE5Q96GU1 130 aa16.08■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 GGA1Q9UJY5 639 aa16.08■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 BBOX1O75936 387 aa16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 UFL1O94874 794 aa16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 SERPINB2P05120 415 aa16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TSPY3P0CV98 308 aa16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TSPY8P0CW00 308 aa16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 PLCD1P51178 756 aa16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 CCDC112Q8NEF3 446 aa16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 ZNF287Q9HBT7 754 aa16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 PODXL2Q9NZ53 605 aa16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 ZNF710Q8N1W2 664 aa16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa16.07■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 UBR3Q6ZT12 1888 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 NAV1Q8NEY1 1877 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 TOP1P11387 765 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 BLIDQ8IZY5 108 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 MAD2L2Q9UI95 211 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 AFF2P51816 1311 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 VWA3AA6NCI4 1184 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 USP17L3A6NCW0 530 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 USP17L4A6NCW7 530 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 PLCG2P16885 1265 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 SYCP1Q15431 976 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 ZNF827Q17R98 1081 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 USP17L1Q7RTZ2 530 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 GSDMAQ96QA5 445 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 LZTS2Q9BRK4 669 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 PCDHA4Q9UN74 947 aa16.06■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 BTDP43251 543 aa16.05■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 AFMP43652 599 aa16.05■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 DPYDQ12882 1025 aa16.05■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 SLC27A3Q5K4L6 730 aa16.05■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 GALNT17Q6IS24 598 aa16.05■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa16.05■□□□□ 0.16
SRA1-201ENST00000336283 SLF2Q8IX21 1173 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms