RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 CSADQ9Y600 493 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 RFX1P22670 979 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 PRR16Q569H4 304 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 CEP128Q6ZU80 1094 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 GPBP1Q86WP2 473 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 ST7Q9NRC1 585 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 LPXNO60711 386 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 EPSTI1Q96J88 318 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF131P52739 623 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRM-201ENST00000332175 MAN1A1P33908 653 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 ABL1P00519 1130 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 CNGA1P29973 690 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 BIRC2Q13490 618 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 ERO1AQ96HE7 468 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 PSMD6Q15008 389 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 PEX26Q7Z412 305 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC89Q8N998 374 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 GIPC1O14908 333 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA0556O60303 1618 aa24.76■■□□□ 1.55
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PTPRM-201ENST00000332175 PTPROQ16827 1216 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 HS1BP3Q53T59 392 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 SLAIN2Q9P270 581 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 FLOT1O75955 427 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D8O95759 1140 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 ME3Q16798 604 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 EP400NLQ6ZTU2 488 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 GPR162Q16538 588 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 HHATQ5VTY9 493 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF10O15013 1369 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 KRBA2Q6ZNG9 492 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 TMTC1Q8IUR5 882 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
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PTPRM-201ENST00000332175 TUBBP07437 444 aa24.74■■□□□ 1.55
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PTPRM-201ENST00000332175 ABCB4P21439 1286 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 C10orf67Q8IYJ2 551 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 SESTD1Q86VW0 696 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 SYCE1Q8N0S2 351 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 VPS37BQ9H9H4 285 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 SCYL2Q6P3W7 929 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA6CA6NDK9 693 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA6DP0CG33 693 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 ELF2Q15723 593 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 BTDP43251 543 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 LONRF2Q1L5Z9 754 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.73■■□□□ 1.55
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PTPRM-201ENST00000332175 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
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PTPRM-201ENST00000332175 NEDD9Q14511 834 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 OGFRQ9NZT2 677 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 SWAP70Q9UH65 585 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0D9SFI3 127 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 GSDMBQ8TAX9 411 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 XKR9Q5GH70 373 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 K7ENM7 598 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 BAG6P46379 1132 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 LIG4P49917 911 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 ATP11AP98196 1134 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRM-201ENST00000332175 PTH1RQ03431 593 aa24.72■■□□□ 1.55
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