RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 MYH8P13535 1937 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 ME1P48163 572 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 STK38Q15208 465 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 DNAJC18Q9H819 358 aa22.14■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 SLURP2P0DP57 97 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 SCG2P13521 617 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 CCDC17Q96LX7 622 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.13■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 SPTLC2O15270 562 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 NR5A1Q13285 461 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 OXER1Q8TDS5 423 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 DACT1Q9NYF0 836 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.12■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 TTLL1O95922 423 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.11■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 FAM196BA6NMK8 535 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 KLRF2D3W0D1 207 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 SLC39A14Q15043 492 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 SIPA1L1O43166 1804 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 CLRN2A0PK11 232 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 CYTH3O43739 400 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 NR1I2O75469 434 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 KRT2P35908 639 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 ADALQ6DHV7 355 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.09■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.08■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 USP17L5A8MUK1 530 aa22.08■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 TNIP1Q15025 636 aa22.08■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.08■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.08■■□□□ 1.13
UPP1-201ENST00000331803 PDHBP11177 359 aa22.08■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 PTPAQ15257 358 aa22.08■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.08■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.08■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 CSRNP1Q96S65 589 aa22.08■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.08■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PQ27 194 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PQ64 194 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PQD8 194 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 SMARCA1P28370 1054 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 NLRP5P59047 1200 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 NPY5RQ15761 445 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 CABP5Q9NP86 173 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.07■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 PPP6R2O75170 966 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 FAM151AQ8WW52 585 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 RBSNQ9H1K0 784 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 TSPY26PQ9H489 355 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 SNHG28P0DPA3 235 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 RASSF7Q02833 373 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 CAMK4Q16566 473 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 JMYQ8N9B5 988 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 CPVLQ9H3G5 476 aa22.06■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 ATP2B2Q01814 1243 aa22.05■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.05■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 FSIP1Q8NA03 581 aa22.05■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.05■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.05■■□□□ 1.12
UPP1-201ENST00000331803 MYO1BO43795 1136 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms