RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 FAM173BQ6P4H8 233 aa27.64■■■□□ 2.02
TMIE-201ENST00000326431 TRPM4Q8TD43 1214 aa27.64■■■□□ 2.02
TMIE-201ENST00000326431 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 TNFAIP1Q13829 316 aa27.64■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 ABCB5Q2M3G0 1257 aa27.64■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 WASF1Q92558 559 aa27.64■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 EPS15P42566 896 aa27.63■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 ATAD5Q96QE3 1844 aa27.63■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 JAG1P78504 1218 aa27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 GPR162Q16538 588 aa27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 TMEM179Q6ZVK1 233 aa27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 RGS22Q8NE09 1264 aa27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 CNPY2Q9Y2B0 182 aa27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 TBC1D12O60347 775 aa27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 SEPT2Q15019 361 aa27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 KRT40Q6A162 431 aa27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 TEPSINQ96N21 525 aa27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 GDPD2Q9HCC8 539 aa27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 LMBRD1Q9NUN5 540 aa27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 V9GY48 417 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 ATP2B2Q01814 1243 aa27.61■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 PKN1Q16512 942 aa27.61■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 MIGA2Q7L4E1 593 aa27.61■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 KANSL2Q9H9L4 492 aa27.61■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 GH2P01242 217 aa27.6■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 GNAQP50148 359 aa27.6■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa27.6■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 USP17L5A8MUK1 530 aa27.6■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 GOLGA8HP0CJ92 632 aa27.6■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 USP17L2Q6R6M4 530 aa27.6■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 PDHBP11177 359 aa27.59■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 EEF2P13639 858 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 NCLP19338 710 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 PTMSP20962 102 aa27.59■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 TRIM29Q14134 588 aa27.59■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 NYAP2Q9P242 653 aa27.59■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 MAP3K10Q02779 954 aa27.58■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 ICA1Q05084 483 aa27.58■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 SLC35G1Q2M3R5 365 aa27.58■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 SIAH1Q8IUQ4 282 aa27.58■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 CABP5Q9NP86 173 aa27.58■■■□□ 2.01
TMIE-201ENST00000326431 DEFB129Q9H1M3 183 aa27.57■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 KLRF2D3W0D1 207 aa27.57■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 SNHG28P0DPA3 235 aa27.57■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 MKL1Q969V6 931 aa27.57■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 KIF28PB7ZC32 967 aa27.56■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 FIBPO43427 364 aa27.56■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 CYTH3O43739 400 aa27.56■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 PIBF1Q8WXW3 757 aa27.56■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 SHISA4Q96DD7 197 aa27.56■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 TRAK2O60296 914 aa27.55■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 KRT85P78386 507 aa27.55■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 USP48Q86UV5 1035 aa27.55■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 LZTS2Q9BRK4 669 aa27.55■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 CPVLQ9H3G5 476 aa27.55■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 GGA3Q9NZ52 723 aa27.55■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 KCNJ14Q9UNX9 436 aa27.55■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 TMEM87AQ8NBN3 555 aa27.55■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 MMP1P03956 469 aa27.54■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 ASPRV1Q53RT3 343 aa27.54■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 SPZ1Q9BXG8 430 aa27.54■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 VPS54Q9P1Q0 977 aa27.54■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa27.54■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 SCG2P13521 617 aa27.53■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 GRIN3BO60391 1043 aa27.52■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 CAP2P40123 477 aa27.52■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 ZNF543Q08ER8 600 aa27.52■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 BRAPQ7Z569 592 aa27.52■■■□□ 2
TMIE-201ENST00000326431 PHF20L1A8MW92 1017 aa27.51■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 XBP1P17861 261 aa27.51■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 SMARCA1P28370 1054 aa27.51■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 DPY19L2Q6NUT2 758 aa27.51■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 UBA5Q9GZZ9 404 aa27.51■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 GPCPD1Q9NPB8 672 aa27.51■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 A0A1W2PRG0 241 aa27.5■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP27.5■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 PHF20Q9BVI0 1012 aa27.5■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms