RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320238.3

NHLH2-201, Transcript of nescient helix-loop-helix 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLH2, Length 2,512 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2-201ENST00000320238 TNFRSF25Q93038 417 aa21.89■■□□□ 1.1
NHLH2-201ENST00000320238 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.89■■□□□ 1.1
NHLH2-201ENST00000320238 URI1O94763 535 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 TFAP4Q01664 338 aa21.89■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.89■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 DACH1Q9UI36 760 aa21.89■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.89■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa21.89■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 PPP2R5BQ15173 497 aa21.88■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 IL17AQ16552 155 aa21.88■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 KANK3Q6NY19 840 aa21.88■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.88■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.88■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 SPATA20Q8TB22 786 aa21.88■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 USP17L3A6NCW0 530 aa21.88■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 USP17L4A6NCW7 530 aa21.88■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 FGRP09769 529 aa21.88■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 SCG2P13521 617 aa21.88■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 DPYDQ12882 1025 aa21.88■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 BARGINQ6ZT62 677 aa21.88■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.88■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 DDAH1O94760 285 aa21.87■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 CALM1P0DP23 149 aa21.87■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 CALM2P0DP24 149 aa21.87■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 CALM3P0DP25 149 aa21.87■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.87■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.87■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 CPVLQ9H3G5 476 aa21.87■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 L2HGDHQ9H9P8 463 aa21.87■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 USP5P45974 858 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 NFIXQ14938 502 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 PLIN2Q99541 437 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 NARFQ9UHQ1 456 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 A0A0U1RQJ8 604 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 ARHGAP6O43182 974 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC93Q567U6 631 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 NGLY1Q96IV0 654 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 WDR24Q96S15 920 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 EPC1Q9H2F5 836 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.86■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 KCNJ6P48051 423 aa21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 CUL4BQ13620 913 aa21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 NR1I3Q14994 352 aa21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 MTRQ99707 1265 aa21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 KAT14Q9H8E8 782 aa21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 OGFRQ9NZT2 677 aa21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 XDHP47989 1333 aa21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 ORC4O43929 436 aa21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 GNG11P61952 73 aa21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 FERMT2Q96AC1 680 aa21.85■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 GOLGA8HP0CJ92 632 aa21.84■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 TM4SF1P30408 202 aa21.84■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.84■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 PP2D1A8MPX8 630 aa21.84■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 RBL2Q08999 1139 aa21.84■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.84■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 NYXQ9GZU5 481 aa21.84■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.84■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 STX8Q9UNK0 236 aa21.84■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.83■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.83■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 PNMA1Q8ND90 353 aa21.83■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 CARD6Q9BX69 1037 aa21.83■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.83■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 SEMA3EO15041 775 aa21.83■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 KIF20AO95235 890 aa21.83■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 SPATA1Q5VX52 437 aa21.83■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.83■■□□□ 1.09
NHLH2-201ENST00000320238 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.83■■□□□ 1.08
NHLH2-201ENST00000320238 A0A1B0GTH6 734 aa21.82■■□□□ 1.08
NHLH2-201ENST00000320238 ZSCAN12O43309 604 aa21.82■■□□□ 1.08
NHLH2-201ENST00000320238 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
NHLH2-201ENST00000320238 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.82■■□□□ 1.08
NHLH2-201ENST00000320238 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms