RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304863.5

UQCRFS1-201, Transcript of ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UQCRFS1, Length 3,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1-201ENST00000304863 ARMT1Q9H993 441 aa15.47■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 HPCAL4Q9UM19 191 aa15.47■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 PHKA1P46020 1223 aa15.46■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 USP14P54578 494 aa15.46■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 STIM1Q13586 685 aa15.46■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 MICALL1Q8N3F8 863 aa15.46■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 CRACR2AQ9BSW2 395 aa15.46■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 MYO1AQ9UBC5 1043 aa15.46■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 ERICH2A1L162 156 aa15.46■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 PRDM1O75626 825 aa15.46■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 MMP14P50281 582 aa15.46■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 UBXN1Q04323 297 aa15.46■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 CAGE1Q8TC20 777 aa15.46■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 GSDMAQ96QA5 445 aa15.46■□□□□ 0.07
UQCRFS1-201ENST00000304863 NDUFA10O95299 355 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 GGCXP38435 758 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 COPB1P53618 953 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 SART3Q15020 963 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 UBE3CQ15386 1083 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 ZNF174Q15697 407 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 ECM29Q5VYK3 1845 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 WNT7AO00755 349 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 PRKAB2O43741 272 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 MAP9Q49MG5 647 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 TDO2P48775 406 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 CCDC122Q5T0U0 273 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 MAGEB6Q8N7X4 407 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 SAR1BQ9Y6B6 198 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 ITIH6Q6UXX5 1313 aa15.45■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 ANKLE2Q86XL3 938 aa15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 KCNJ18B7U540 433 aa15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 ITGA6P23229 1130 aa15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 GPTP24298 496 aa15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 KCNJ12Q14500 433 aa15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 COG1Q8WTW3 980 aa15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 TMEM94Q12767 1356 aa15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 SEMA3EO15041 775 aa15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 MYBL2P10244 700 aa15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 CCT5P48643 541 aa15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 E2F4Q16254 413 aa15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 GREM2Q9H772 168 aa15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 VIPAS39Q9H9C1 493 aa15.44■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 FECHP22830 423 aa15.43■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 FANCBQ8NB91 859 aa15.43■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 NELFBQ8WX92 580 aa15.43■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 TTC26A0AVF1 554 aa15.43■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 ZNF185O15231 689 aa15.43■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 PAK1Q13153 545 aa15.43■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 KIAA1328Q86T90 577 aa15.43■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 ZNF654Q8IZM8 581 aa15.43■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 KRT23Q9C075 422 aa15.43■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 EHD4Q9H223 541 aa15.43■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 CNNM2Q9H8M5 875 aa15.43■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 MST1RQ04912 1400 aa15.43■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 LIG3P49916 1009 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 TCIRG1Q13488 830 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 TADA2BQ86TJ2 420 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 EFCAB13Q8IY85 973 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 SHISA4Q96DD7 197 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 DEF6Q9H4E7 631 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 FAM76AQ8TAV0 307 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 JAKMIP2Q96AA8 810 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 SELENOOQ9BVL4 669 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 KAT14Q9H8E8 782 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 ABCC12Q96J65 1359 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 XDHP47989 1333 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 GOLGA6CA6NDK9 693 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 GOLGA6DP0CG33 693 aa15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
UQCRFS1-201ENST00000304863 TTLL11Q8NHH1 800 aa15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.2 ms