RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 ZFPM1Q8IX07 1006 aa16.81■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.81■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 CTAGE5O15320 804 aa16.8■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 RAD17O75943 681 aa16.8■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 AKR1B1P15121 316 aa16.8■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 KLRF2D3W0D1 207 aa16.8■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa16.8■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 CMA1P23946 247 aa16.79■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 POLD1P28340 1107 aa16.79■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 PLCB2Q00722 1185 aa16.79■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 CFAP100Q494V2 611 aa16.79■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 USP17L2Q6R6M4 530 aa16.79■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 RASGRP2Q7LDG7 609 aa16.79■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 CLIC6Q96NY7 704 aa16.79■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 TRIM34Q9BYJ4 488 aa16.79■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa16.79■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 ATP2B2Q01814 1243 aa16.79■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 PSMD1Q99460 953 aa16.79■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 MTMR4Q9NYA4 1195 aa16.79■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 PIM2Q9P1W9 311 aa16.79■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 FAM205CA6NFA0 338 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 UVSSAQ2YD98 709 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 CCDC125Q86Z20 511 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 CLIP2Q9UDT6 1046 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 CEP131Q9UPN4 1083 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 MRVI1Q9Y6F6 885 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 FOCADQ5VW36 1801 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 ZNF202O95125 648 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 SLURP2P0DP57 97 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 PFKFB1P16118 471 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 ANO6Q4KMQ2 910 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 CLEC10AQ8IUN9 316 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 PPP1R9BQ96SB3 815 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 LZTS2Q9BRK4 669 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 CPVLQ9H3G5 476 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 VAT1LQ9HCJ6 419 aa16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 SHMT1P34896 483 aa16.77■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa16.77■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 IDI2Q9BXS1 227 aa16.77■□□□□ 0.28
NICN1-201ENST00000273598 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 TRIM75PA6NK02 468 aa16.77■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 FAM196BA6NMK8 535 aa16.77■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 CYTH3O43739 400 aa16.77■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 CUTAO60888 179 aa16.77■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 HOMER1Q86YM7 354 aa16.77■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 PI4KBQ9UBF8 816 aa16.77■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 FAM198AQ9UFP1 575 aa16.77■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 USP17L5A8MUK1 530 aa16.76■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 TTLL1O95922 423 aa16.76■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 CALML3P27482 149 aa16.76■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 SYKP43405 635 aa16.76■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 SHC4Q6S5L8 630 aa16.76■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 OGFOD1Q8N543 542 aa16.76■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 PSMD14O00487 310 aa16.76■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 SPECC1Q5M775 1068 aa16.76■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa16.76■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 FAM200AQ8TCP9 573 aa16.76■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 USP25Q9UHP3 1055 aa16.76■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 TGFB2P61812 414 aa16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 SOGA3Q5TF21 947 aa16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 NIM1KQ8IY84 436 aa16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 EHD4Q9H223 541 aa16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 RAD21O60216 631 aa16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 NPY5RQ15761 445 aa16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 SLC35G1Q2M3R5 365 aa16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 CCDC17Q96LX7 622 aa16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 DNAJC25Q9H1X3 360 aa16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 TMOD2Q9NZR1 351 aa16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 MYO3BQ8WXR4 1341 aa16.75■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 ZNF174Q15697 407 aa16.74■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
NICN1-201ENST00000273598 BLIDQ8IZY5 108 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms