RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 SLFN13Q68D06 897 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 PCP11498 1178 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 TECP42680 631 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 DYMQ7RTS9 669 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 SP8Q8IXZ3 490 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 COA7Q96BR5 231 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 MMP1P03956 469 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF827Q17R98 1081 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 SCLT1Q96NL6 688 aa11.68□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 TBC1D7Q9P0N9 293 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 COBLO75128 1261 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 TTLL1O95922 423 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 TNNT1P13805 278 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 WWC2Q6AWC2 1192 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 PDCL3Q9H2J4 239 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 H7C1D1 291 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 SORBS3O60504 671 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 LIFRP42702 1097 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 PTGDRQ13258 359 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 NF2P35240 595 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 GSDMDP57764 484 aa11.67□□□□□ -0.54
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TTPAL-201ENST00000262605 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 CSRNP2Q9H175 543 aa11.67□□□□□ -0.54
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TTPAL-201ENST00000262605 PSMA7O14818 248 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 NEMFO60524 1076 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 SKILP12757 684 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 DNA2P51530 1060 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 NLRP12P59046 1061 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 SV2BQ7L1I2 683 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 DEFB132Q7Z7B7 95 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.67□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 CABP7Q86V35 215 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 LRWD1Q9UFC0 647 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 PDE4DQ08499 809 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
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TTPAL-201ENST00000262605 LRRC27Q9C0I9 530 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 TMOD4Q9NZQ9 345 aa11.66□□□□□ -0.54
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TTPAL-201ENST00000262605 UBXN2AP68543 259 aa11.66□□□□□ -0.54
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TTPAL-201ENST00000262605 OXER1Q8TDS5 423 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 SWAP70Q9UH65 585 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 GUCY1A2P33402 732 aa11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 PLCD1P51178 756 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 ANTXR2P58335 489 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 TRAF1Q13077 416 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 TSGA10IPQ3SY00 556 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 FBXO33Q7Z6M2 555 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 ADGRA1Q86SQ6 560 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 FAM114A1Q8IWE2 563 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 PIM2Q9P1W9 311 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 CDC25AP30304 524 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 NSMFQ6X4W1 530 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 PCDHA4Q9UN74 947 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 UBXN1Q04323 297 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 UBE2SQ16763 222 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 GPIHBP1Q8IV16 184 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 FERMT2Q96AC1 680 aa11.65□□□□□ -0.54
TTPAL-201ENST00000262605 MRC1P22897 1456 aa11.65□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 ALX1Q15699 326 aa11.65□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.65□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 RTKN2Q8IZC4 609 aa11.65□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa11.65□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00301Q8NCQ3 95 aa11.65□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 CRAMP1Q96RY5 1269 aa11.65□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 KIF28PB7ZC32 967 aa11.64□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 KIF20AO95235 890 aa11.64□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 PRR16Q569H4 304 aa11.64□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC150Q8NCX0 1101 aa11.64□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 BICD1Q96G01 975 aa11.64□□□□□ -0.55
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM47Q9BQJ4 181 aa11.64□□□□□ -0.55
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