RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 GCNAQ96QF7 691 aa11.67□□□□□ -0.54
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TRPS1-201ENST00000220888 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
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TRPS1-201ENST00000220888 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
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TRPS1-201ENST00000220888 MYO1AQ9UBC5 1043 aa11.66□□□□□ -0.54
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TRPS1-201ENST00000220888 USP17L21D6R901 530 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPS1-201ENST00000220888 STAM2O75886 525 aa11.66□□□□□ -0.54
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TRPS1-201ENST00000220888 C1orf112Q9NSG2 853 aa11.66□□□□□ -0.54
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TRPS1-201ENST00000220888 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRPS1-201ENST00000220888 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 RSAD2Q8WXG1 361 aa11.65□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 CHMP6Q96FZ7 201 aa11.65□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 CSRNP1Q96S65 589 aa11.65□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa11.65□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 TTC36A6NLP5 189 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 I3L4J1 428 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 TUBBP07437 444 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 ARPP19P56211 112 aa11.64□□□□□ -0.55
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