RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	ENT2	Q05785	613 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	MCP2	Q06567	569 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	SEC39	Q12745	709 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	UBR1	P19812	1950 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	INH1	P01097	85 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	YKR104W	P0CE69	306 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	RED1	P14291	827 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	MRPL8	P22353	238 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	MNE1	P24720	663 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	SNT1	P25357	1226 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	KAR9	P32526	644 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	TFC3	P34111	1160 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	PRM9	P39551	298 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	CFD1	P40558	293 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	PHO86	P46956	311 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	YGR237C	P50089	785 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	GIC2	Q06648	383 aa		5.92	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.92	□□□□□ -1.46	not detected
SYF2	YGR129W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	ADY2	P25613	283 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	APL1	P27351	700 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	GYP6	P32806	458 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	BCD1	P38772	366 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	YER189W	P40104	122 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	SAP185	P40856	1058 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	PEX31	P53203	462 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	INA17	Q02888	182 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	VHS1	Q03785	461 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	INP2	Q03824	705 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	YPR114W	Q06107	315 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	AIM39	Q08223	395 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	PUT4	P15380	627 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	LYP1	P32487	611 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	YKL050C	P35736	922 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	PIM1	P36775	1133 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	LYS9	P38999	446 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	PAN6	P40459	309 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	IPI3	P53877	555 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	SDH1	Q00711	640 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	PPN1	Q04119	674 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	BSC6	Q08280	497 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	GLE1	Q12315	538 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	VPS5	Q92331	675 aa		5.9	□□□□□ -1.46
SYF2	YGR129W	MTF2	P10849	440 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	BIK1	P11709	440 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	EFM2	P38347	419 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SPT8	P38915	602 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	TMA108	P40462	946 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	CIR1	P42940	261 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	UBX6	P47049	396 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	STP3	Q05937	343 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	CDA2	Q06703	312 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SPO75	Q07798	868 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	TRE2	Q08693	809 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	AFT2	Q08957	416 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YOR223W	Q12015	292 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.89	□□□□□ -1.47	not detected
SYF2	YGR129W	BI2	P03873	423 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	ALY1	P36117	915 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	FUI1	P38196	639 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	FAU1	P40099	211 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SNZ3	P43545	298 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SNZ2	P53824	298 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SND1	Q04007	877 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	UFO1	Q04511	668 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	GRX8	Q05926	109 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YDL073W	Q07454	984 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YAP7	Q08182	245 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	GUP2	Q08929	609 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YPL066W	Q12194	479 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	PMA2	P19657	947 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	MSH3	P25336	1018 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	RNQ1	P25367	405 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	LDB16	P25587	256 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	SMF1	P38925	575 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF2	YGR129W	YAL037W	P39728	267 aa		5.87	□□□□□ -1.47

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