RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638817.1

PARL-211, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 5

Gene PARL, Length 1,534 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-211ENST00000638817 USP17L22D6RA61 530 aa24.74■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.74■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 USP17L19D6RCP7 530 aa24.74■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 USP17L20D6RJB6 530 aa24.74■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 CYP2B6P20813 491 aa24.74■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 GABPAQ06546 454 aa24.74■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 USP17L24Q0WX57 530 aa24.74■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 TRIM32Q13049 653 aa24.74■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.74■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.74■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.74■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.73■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 APBB1O00213 710 aa24.73■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 GOLIM4O00461 696 aa24.73■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 PDE3AQ14432 1141 aa24.73■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.73■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 USP6NLQ92738 828 aa24.73■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.73■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.73■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 ALPK3Q96L96 1907 aa24.73■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.72■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 GPR142Q7Z601 462 aa24.72■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.72■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 PORCNQ9H237 461 aa24.72■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 MORN1Q5T089 497 aa24.71■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 LBX2Q6XYB7 198 aa24.71■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 PRO3102Q9H379 93 aa24.71■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 EVI5O60447 810 aa24.71■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 CNMDO75829 334 aa24.71■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 VCAM1P19320 739 aa24.71■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 GUCY1A2P33402 732 aa24.71■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.71■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 ACER1Q8TDN7 264 aa24.71■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.71■■□□□ 1.55
PARL-211ENST00000638817 RGS2P41220 211 aa24.7■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 LCORLQ8N3X6 602 aa24.7■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 CCNA1P78396 465 aa24.69■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.69■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.69■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.69■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.68■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 ATP5JP18859 108 aa24.68■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 SEPT2Q15019 361 aa24.68■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.68■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 APBA2Q99767 749 aa24.68■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 MYH8P13535 1937 aa24.68■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 ADD2P35612 726 aa24.67■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.67■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 MYH7P12883 1935 aa24.67■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 EVX2Q03828 476 aa24.66■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 HAUS7Q99871 368 aa24.66■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 NBPF3Q9H094 633 aa24.66■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 SWAP70Q9UH65 585 aa24.66■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 MAP2K5Q13163 448 aa24.66■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 ARMT1Q9H993 441 aa24.66■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.66■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 BTBD7Q9P203 1132 aa24.65■■□□□ 1.54
PARL-211ENST00000638817 A0A1W2PPC1 479 aa24.64■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 A0A1W2PRG0 241 aa24.64■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.64■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 CCL14Q16627 93 aa24.64■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.64■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 C11orf49Q9H6J7 331 aa24.64■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 MBD4O95243 580 aa24.63■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 CYP2D6P10635 497 aa24.63■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 PTPREP23469 700 aa24.63■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 UBE3CQ15386 1083 aa24.63■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 BCL11AQ9H165 835 aa24.63■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.62■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 RLFQ13129 1914 aa24.62■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.62■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 PRKAB2O43741 272 aa24.61■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 HOXC6P09630 235 aa24.61■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 COG2Q14746 738 aa24.61■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 LHX8Q68G74 356 aa24.61■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.61■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.61■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.61■■□□□ 1.53
PARL-211ENST00000638817 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms