RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	LGR6	Q9HBX8	967 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	STOML1	Q9UBI4	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	MSTN	O14793	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	EOMES	O95936	686 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	IGHA1	P01876	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	RAB33A	Q14088	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	SHISA5	Q8N114	240 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	VWCE	Q96DN2	955 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	MIPEP	Q99797	713 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	GSC2	O15499	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	DYRK3	O43781	588 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	LEFTY1	O75610	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	F13B	P05160	661 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	NFIA	Q12857	509 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	FST	P19883	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	ETV3	P41162	512 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	SLC51A	Q86UW1	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	RNF141	Q8WVD5	230 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	FAM170B	A6NMN3	283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	GBP1	P32455	592 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	DDR2	Q16832	855 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	CDH24	Q86UP0	819 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	MKL1	Q969V6	931 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	SLC6A18	Q96N87	628 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	CLEC3A	O75596	197 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	CYP27A1	Q02318	531 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	FXN	Q16595	210 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175		U3KQE9	123 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	PRR19	A6NJB7	356 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175		B2RBV5	119 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175		C9IYK1	514 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	SHOX	O15266	292 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	KIR3DL1	P43629	444 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	OXCT1	P55809	520 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	RNF4	P78317	190 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	RASA3	Q14644	834 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATRX-223	ENST00000637175	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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