RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
DNM1-222	ENST00000636280	LIG1	P18858	919 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	18.45	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	TGFB2	P61812	414 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	18.45	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	POLD1	P28340	1107 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	PKN1	Q16512	942 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	STX8	Q9UNK0	236 aa		18.45	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	MMP1	P03956	469 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	PIM2	Q9P1W9	311 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	CACNB3	P54284	484 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	18.44	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	CLIC4	Q9Y696	253 aa		18.44	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	KIF5B	P33176	963 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	BICD2	Q8TD16	824 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	SHISA4	Q96DD7	197 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	MAP3K14	Q99558	947 aa		18.43	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	COL4A5	P29400	1685 aa		18.42	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	BTBD18	B2RXH4	712 aa		18.42	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	RAD17	O75943	681 aa		18.42	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	18.42	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	SOGA3	Q5TF21	947 aa		18.42	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	CEP95	Q96GE4	821 aa		18.42	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	YEATS4	O95619	227 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	GRM4	Q14833	912 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	ANO1	Q5XXA6	986 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	IDI2	Q9BXS1	227 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	DACT1	Q9NYF0	836 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	ME1	P48163	572 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	TCP10	Q12799	353 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	STK38	Q15208	465 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		18.41	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	HLA-DOA	P06340	250 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	CFAP100	Q494V2	611 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	RBSN	Q9H1K0	784 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	SWAP70	Q9UH65	585 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	MYH6	P13533	1939 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	PSMD14	O00487	310 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	AKR1B1	P15121	316 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	SHMT1	P34896	483 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	NOV	P48745	357 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	VPS33B	Q9H267	617 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	MTMR7	Q9Y216	660 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		18.4	■□□□□ 0.54
DNM1-222	ENST00000636280	NR1I2	O75469	434 aa		18.39	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	XBP1	P17861	261 aa		18.39	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		18.39	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	OXER1	Q8TDS5	423 aa		18.39	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		18.39	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	SPTLC2	O15270	562 aa		18.39	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	SLURP2	P0DP57	97 aa		18.39	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	NR5A1	Q13285	461 aa		18.39	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		18.39	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	EHD4	Q9H223	541 aa		18.39	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	GML	Q99445	158 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	TSPY26P	Q9H489	355 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	PSME4	Q14997	1843 aa		18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
DNM1-222	ENST00000636280	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53

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