RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB3GAP1Q15042 981 aa33.44■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CNGA1P29973 690 aa33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 POTEEQ6S8J3 1075 aa33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 MIGA1Q8NAN2 632 aa33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa33.43■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 IDH1O75874 414 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SURF6O75683 361 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CNMDO75829 334 aa33.41■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 USP14P54578 494 aa33.41■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP2B2Q01814 1243 aa33.41■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 C12orf42Q96LP6 360 aa33.41■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 BCAR3O75815 825 aa33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 FLRT1Q9NZU1 646 aa33.4■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC15A5A6NIM6 579 aa33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 IGSF3O75054 1194 aa33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINB13Q9UIV8 391 aa33.39■■■□□ 2.94
CAPNS1-217ENST00000629983 VCAM1P19320 739 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPREP23469 700 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 POLA2Q14181 598 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CABP5Q9NP86 173 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa33.38■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCB5Q2M3G0 1257 aa33.37■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM57Q8N5G2 664 aa33.37■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
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CAPNS1-217ENST00000629983 MSCO60682 206 aa33.36■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 TATDN1Q6P1N9 297 aa33.36■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC6Q86TZ1 520 aa33.36■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CERS3Q8IU89 383 aa33.36■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEB6Q8N7X4 407 aa33.36■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ACER1Q8TDN7 264 aa33.36■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa33.36■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CUL9Q8IWT3 2517 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SSH3Q8TE77 659 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM161BQ96MY7 647 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf115Q9H7X2 142 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 BTBD7Q9P203 1132 aa33.35■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0C4DFX4 3053 aa33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP2C19P33261 490 aa33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP8B2P98198 1209 aa33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 LPAR1Q92633 364 aa33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 EHD4Q9H223 541 aa33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 GRB14Q14449 540 aa33.33■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 NPLOC4Q8TAT6 608 aa33.33■■■□□ 2.93
CAPNS1-217ENST00000629983 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
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CAPNS1-217ENST00000629983 DNM1LO00429 736 aa33.31■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 RTP1P59025 263 aa33.31■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 DPP9Q86TI2 863 aa33.31■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa33.31■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa33.31■■■□□ 2.92
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CAPNS1-217ENST00000629983 HOXC6P09630 235 aa33.3■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K12Q12852 859 aa33.3■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa33.3■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 LBX2Q6XYB7 198 aa33.3■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP33.3■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 GUCD1Q96NT3 240 aa33.29■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF697Q5TEC3 545 aa33.28■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPV1Q8NER1 839 aa33.28■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 KBTBD13C9JR72 458 aa33.27■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 POTEB2H3BUK9 544 aa33.27■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 SHMT1P34896 483 aa33.27■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 TANGO6Q9C0B7 1094 aa33.27■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 ANTXR1Q9H6X2 564 aa33.27■■■□□ 2.92
CAPNS1-217ENST00000629983 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
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CAPNS1-217ENST00000629983 PLCD1P51178 756 aa33.26■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SEPT2Q15019 361 aa33.26■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ANO1Q5XXA6 986 aa33.26■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ARRDC4Q8NCT1 418 aa33.26■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ADORA2AP29274 412 aa33.25■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 GUCY1A2P33402 732 aa33.23■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 ITPRIPQ8IWB1 547 aa33.23■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 MYH1P12882 1939 aa33.22■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa33.22■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 COG2Q14746 738 aa33.22■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXC10Q9NYD6 342 aa33.22■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 FRMPD3Q5JV73 1810 aa33.22■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 PLS1Q14651 629 aa33.21■■■□□ 2.91
CAPNS1-217ENST00000629983 OLFML2BQ68BL8 750 aa33.21■■■□□ 2.91
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