RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 RAI14Q9P0K7 980 aa15.28■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 DNAI1Q9UI46 699 aa15.28■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MAST2Q6P0Q8 1798 aa15.27■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.27■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 SMIM5Q71RC9 77 aa15.27■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 MLKLQ8NB16 471 aa15.27■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 ESR2Q92731 530 aa15.27■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 PARP3Q9Y6F1 533 aa15.27■□□□□ 0.04
C9orf170-201ENST00000623052 NMT2O60551 498 aa15.27■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 CTR9Q6PD62 1173 aa15.27■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa15.27■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.27■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 IGSF3O75054 1194 aa15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 PLCD1P51178 756 aa15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 DHX58Q96C10 678 aa15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 DPYDQ12882 1025 aa15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 CUL4BQ13620 913 aa15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 SBF2Q86WG5 1849 aa15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 KCNQ2O43526 872 aa15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 NR1I3Q14994 352 aa15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 DDB1Q16531 1140 aa15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 V9GY48 417 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 FCHSD1Q86WN1 690 aa15.25■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 WDR24Q96S15 920 aa15.25■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 MINPP1Q9UNW1 487 aa15.25■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 COL24A1Q17RW2 1714 aa15.25■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1B0GTH6 734 aa15.25■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM75PA6NK02 468 aa15.25■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGAP6O43182 974 aa15.25■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 TEX33O43247 280 aa15.25■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 KRT2P35908 639 aa15.25■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa15.25■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 HOMER1Q86YM7 354 aa15.25■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 PAGE5Q96GU1 130 aa15.25■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 MTF1Q14872 753 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 TMTC3Q6ZXV5 915 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 AFMP43652 599 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 IL17AQ16552 155 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 SLC51AQ86UW1 340 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 ST7Q9NRC1 585 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 CEP131Q9UPN4 1083 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 KCNQ4P56696 695 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 UBE4AQ14139 1066 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0U1RQJ8 604 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 CYP2D6P10635 497 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 PBX1P40424 430 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 KIFC2Q96AC6 838 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 XDHP47989 1333 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 NRDCO43847 1150 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 TADA3O75528 432 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 TUBB4AP04350 444 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 SLFN14P0C7P3 912 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 CLCN6P51797 869 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF174Q15697 407 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 E2F4Q16254 413 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 MTRQ99707 1265 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 DESI2Q9BSY9 194 aa15.23■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa15.22■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 USP17L12C9JPN9 530 aa15.22■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 USP17L21D6R901 530 aa15.22■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 STX17P56962 302 aa15.22■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 CDKAL1Q5VV42 579 aa15.22■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 CCP110O43303 1012 aa15.22■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 STX10O60499 249 aa15.22■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 COBLO75128 1261 aa15.22■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 MECOMQ03112 1051 aa15.22■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 PPP2R5BQ15173 497 aa15.22■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.22■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 CATIPQ7Z7H3 387 aa15.22■□□□□ 0.03
C9orf170-201ENST00000623052 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms