RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	RAD17	O75943	681 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	LDHC	P07864	332 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	NLRP5	P59047	1200 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC96	Q2M329	555 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ESR2	Q92731	530 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	GJA10	Q969M2	543 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	11.29	□□□□□ -0.6	9e-7	■■□□□ 11.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SCN7A	Q01118	1682 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	SRGN	P10124	158 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC16A2	P36021	539 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	GSTO1	P78417	241 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TFAP4	Q01664	338 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ALX1	Q15699	326 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	LY75	O60449	1722 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC192	P0DO97	292 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	PPARD	Q03181	441 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	RTN1	Q16799	776 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	IQCA1	Q86XH1	822 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	DHX58	Q96C10	678 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	MASTL	Q96GX5	879 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	UBE2H	P62256	183 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	SP8	Q8IXZ3	490 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	OXER1	Q8TDS5	423 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM87B	Q96K49	555 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	11.28	□□□□□ -0.6	7e-7	■■■■■ 79
CTCFL-222	ENST00000609232	FZD1	Q9UP38	647 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	PTGS1	P23219	599 aa		11.27	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		11.27	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF384	Q8TF68	577 aa		11.27	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.6
CTCFL-222	ENST00000609232	LRP5	O75197	1615 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	FOXN1	O15353	648 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	DNA2	P51530	1060 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT40	Q6A162	431 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	TNKS	O95271	1327 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	SERPINC1	P01008	464 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	APOA5	Q6Q788	366 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	TEX11	Q8IYF3	940 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	C21orf2	O43822	256 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	SP4	Q02446	784 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	TMC4	Q7Z404	712 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	HINFP	Q9BQA5	517 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	CDKL5	O76039	1030 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	CTDNEP1	O95476	244 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	BTD	P43251	543 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	UBXN2A	P68543	259 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	TYRO3	Q06418	890 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	PDE4B	Q07343	736 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CTCFL-222	ENST00000609232	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61

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