RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 RLFQ13129 1914 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 CTGFP29279 349 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 RGS19P49795 217 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 USP14P54578 494 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 TRIM47Q96LD4 638 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 CCDC17Q96LX7 622 aa20.6■□□□□ 0.89
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HERC3-214ENST00000601319 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.57■□□□□ 0.88
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HERC3-214ENST00000601319 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC3-214ENST00000601319 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
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HERC3-214ENST00000601319 HERVK_113P62684 666 aa20.55■□□□□ 0.88
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HERC3-214ENST00000601319 SH2D4AQ9H788 454 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-214ENST00000601319 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-214ENST00000601319 MYPNQ86TC9 1320 aa20.54■□□□□ 0.88
HERC3-214ENST00000601319 A0A1W2PRG0 241 aa20.54■□□□□ 0.88
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HERC3-214ENST00000601319 ICA1Q05084 483 aa20.54■□□□□ 0.88
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HERC3-214ENST00000601319 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.54■□□□□ 0.88
HERC3-214ENST00000601319 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.54■□□□□ 0.88
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HERC3-214ENST00000601319 USP17L19D6RCP7 530 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-214ENST00000601319 USP17L20D6RJB6 530 aa20.53■□□□□ 0.88
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HERC3-214ENST00000601319 USP17L24Q0WX57 530 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-214ENST00000601319 LPAR1Q92633 364 aa20.53■□□□□ 0.88
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HERC3-214ENST00000601319 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HERC3-214ENST00000601319 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.53■□□□□ 0.88
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HERC3-214ENST00000601319 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.52■□□□□ 0.88
HERC3-214ENST00000601319 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.52■□□□□ 0.88
HERC3-214ENST00000601319 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HERC3-214ENST00000601319 RASA1P20936 1047 aa20.52■□□□□ 0.88
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HERC3-214ENST00000601319 LBX2Q6XYB7 198 aa20.52■□□□□ 0.88
HERC3-214ENST00000601319 NBPF11Q86T75 865 aa20.52■□□□□ 0.88
HERC3-214ENST00000601319 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.52■□□□□ 0.88
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HERC3-214ENST00000601319 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.52■□□□□ 0.88
HERC3-214ENST00000601319 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.52■□□□□ 0.88
HERC3-214ENST00000601319 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
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HERC3-214ENST00000601319 ZMYM6O95789 1325 aa20.51■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 A0A0D9SFI3 127 aa20.5■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 IRF5Q13568 498 aa20.5■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.5■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.5■□□□□ 0.87
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HERC3-214ENST00000601319 COA7Q96BR5 231 aa20.5■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 FAM227BQ96M60 508 aa20.5■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.5■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.5■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.5■□□□□ 0.87
HERC3-214ENST00000601319 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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