RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597474.5

FCHO1-220, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-220ENST00000597474 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa15.87■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 RLBP1P12271 317 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 RGS2P41220 211 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 MAGEB6Q8N7X4 407 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 C12orf42Q96LP6 360 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 APBA2Q99767 749 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 ANTXR1Q9H6X2 564 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 LTBP2Q14767 1821 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF236Q9UL36 1845 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 IGSF3O75054 1194 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 USP5P45974 858 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 LRRC26Q2I0M4 334 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 Q7L0L9 218 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 ACER1Q8TDN7 264 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 FEZ1Q99689 392 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 FLRT1Q9NZU1 646 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 SERPINB13Q9UIV8 391 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 USP17L15C9J2P7 530 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 USP17L11C9JVI0 530 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 USP17L18D6R9N7 530 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 USP17L22D6RA61 530 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 USP17L19D6RCP7 530 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 USP17L20D6RJB6 530 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 USP17L24Q0WX57 530 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 MAP2K5Q13163 448 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 RAB3GAP1Q15042 981 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 TDHQ8IZJ6 230 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 EHD4Q9H223 541 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 MYH7P12883 1935 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-220ENST00000597474 VCAM1P19320 739 aa15.83■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 GUCY1A2P33402 732 aa15.83■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 SHMT1P34896 483 aa15.83■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 PLCD1P51178 756 aa15.83■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 EVX2Q03828 476 aa15.83■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 LRIT3Q3SXY7 679 aa15.83■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa15.83■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 ITPRIPQ8IWB1 547 aa15.83■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 DEFB123Q8N688 67 aa15.83■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa15.83■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 BTBD7Q9P203 1132 aa15.83■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 SMCHD1A6NHR9 2005 aa15.82■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 ABCB5Q2M3G0 1257 aa15.82■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 GPR153Q6NV75 609 aa15.82■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 PTPREP23469 700 aa15.81■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 USP14P54578 494 aa15.81■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 CCNA1P78396 465 aa15.81■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 WDR78Q5VTH9 848 aa15.81■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 CEP85Q6P2H3 762 aa15.81■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 LBX2Q6XYB7 198 aa15.81■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 TTC6Q86TZ1 520 aa15.81■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 CERS3Q8IU89 383 aa15.81■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 NPLOC4Q8TAT6 608 aa15.81■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa15.81■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa15.81■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 SLC15A5A6NIM6 579 aa15.8■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 MAP3K12Q12852 859 aa15.8■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 GRB14Q14449 540 aa15.8■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 SEPT2Q15019 361 aa15.8■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 AACSQ86V21 672 aa15.8■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 MTMR10Q9NXD2 777 aa15.8■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 IGHA2P01877 340 aa15.79■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 HOXC6P09630 235 aa15.79■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 CYP2C19P33261 490 aa15.79■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 GABPAQ06546 454 aa15.79■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 MFSD14CQ5VZR4 134 aa15.79■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 TRPV1Q8NER1 839 aa15.79■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 A0A1W2PRG0 241 aa15.78■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 CNGA1P29973 690 aa15.78■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa15.78■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 CABP5Q9NP86 173 aa15.78■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa15.78■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 VCANP13611 3396 aa15.78■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 CDH23Q9H251 3354 aa15.78■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa15.77■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
FCHO1-220ENST00000597474 PDE6AP16499 860 aa15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms