RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593586.1

TTC9B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

Gene TTC9B, Length 2,323 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-202ENST00000593586 COL4A1P02462 1669 aa22.97■■□□□ 1.27
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TTC9B-202ENST00000593586 PRDM1O75626 825 aa22.97■■□□□ 1.27
TTC9B-202ENST00000593586 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TTC9B-202ENST00000593586 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.97■■□□□ 1.27
TTC9B-202ENST00000593586 NR1I3Q14994 352 aa22.97■■□□□ 1.27
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TTC9B-202ENST00000593586 CALM1P0DP23 149 aa22.94■■□□□ 1.26
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TTC9B-202ENST00000593586 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.94■■□□□ 1.26
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TTC9B-202ENST00000593586 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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TTC9B-202ENST00000593586 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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TTC9B-202ENST00000593586 USP17L12C9JPN9 530 aa22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-202ENST00000593586 USP17L21D6R901 530 aa22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-202ENST00000593586 STX17P56962 302 aa22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-202ENST00000593586 PANX2Q96RD6 677 aa22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-202ENST00000593586 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-202ENST00000593586 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-202ENST00000593586 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-202ENST00000593586 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-202ENST00000593586 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-202ENST00000593586 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
TTC9B-202ENST00000593586 A0A1B0GUL6 1792 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC9B-202ENST00000593586 MAP3K9P80192 1104 aa22.89■■□□□ 1.25
TTC9B-202ENST00000593586 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TTC9B-202ENST00000593586 PTGDRQ13258 359 aa22.89■■□□□ 1.25
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