RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 APBA2Q99767 749 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB3GAP1Q15042 981 aa31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L15C9J2P7 530 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L13C9JLJ4 530 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L11C9JVI0 530 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L18D6R9N7 530 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L22D6RA61 530 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L17D6RBQ6 530 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L19D6RCP7 530 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L20D6RJB6 530 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 USP17L24Q0WX57 530 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K12Q12852 859 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 LHX8Q68G74 356 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ACER1Q8TDN7 264 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 COL6A1P12109 1028 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCB5Q2M3G0 1257 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC6Q86TZ1 520 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 AACSQ86V21 672 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 MYH1P12882 1939 aa31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 VCAM1P19320 739 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 SHMT1P34896 483 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 PLCD1P51178 756 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP2K5Q13163 448 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 USP14P54578 494 aa31.2■■■□□ 2.59
CAPNS1-211ENST00000590874 GUCY1A2P33402 732 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 FLRT1Q9NZU1 646 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNA1P78396 465 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 EVX2Q03828 476 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 ERC1Q8IUD2 1116 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 BTBD7Q9P203 1132 aa31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR78Q5VTH9 848 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 LBX2Q6XYB7 198 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 CABP5Q9NP86 173 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPREP23469 700 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC26Q2I0M4 334 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 GABPAQ06546 454 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC15A5A6NIM6 579 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 SEPT2Q15019 361 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 TDHQ8IZJ6 230 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PANK1Q8TE04 598 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE6AP16499 860 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 GRB14Q14449 540 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 LRIT3Q3SXY7 679 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD14CQ5VZR4 134 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 RHPN1Q8TCX5 695 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC17A8Q8NDX2 589 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 NPLOC4Q8TAT6 608 aa31.12■■■□□ 2.57
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CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PRG0 241 aa31.11■■■□□ 2.57
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CAPNS1-211ENST00000590874 GPR153Q6NV75 609 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 NAV1Q8NEY1 1877 aa31.11■■■□□ 2.57
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF532Q9HCE3 1301 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 Q7L0L9 218 aa31.1■■■□□ 2.57
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CAPNS1-211ENST00000590874 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP2B2Q01814 1243 aa31.09■■■□□ 2.57
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CAPNS1-211ENST00000590874 FRMPD3Q5JV73 1810 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
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CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2C19P33261 490 aa31.08■■■□□ 2.57
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CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB123Q8N688 67 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC44A5Q8NCS7 719 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPV1Q8NER1 839 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-211ENST00000590874 APBB1O00213 710 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLIM4O00461 696 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHA2P01877 340 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 CNGA1P29973 690 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-211ENST00000590874 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
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