RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590205.2

CACNA1A-210, Transcript of calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A, humanhuman

Gene CACNA1A, Length 3,340 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1A-210ENST00000590205 PTPN14Q15678 1187 aa9.52□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 MPNDQ8N594 471 aa9.52□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 SENP2Q9HC62 589 aa9.52□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.52□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 FANCCQ00597 558 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 MYL5Q02045 173 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 SEMA3FQ13275 785 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 NPY5RQ15761 445 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 CHST3Q7LGC8 479 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 KIFC2Q96AC6 838 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 MASTLQ96GX5 879 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 COL4A5P29400 1685 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 NPR1P16066 1061 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 NR1I3Q14994 352 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 FAM89AQ96GI7 184 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 PIM2Q9P1W9 311 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9.51□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 LRRC10BA6NIK2 292 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 SLC5A1P13866 664 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 STK38Q15208 465 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 JMYQ8N9B5 988 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 CRAMP1Q96RY5 1269 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 A0A1B0GTH6 734 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 CUL4BQ13620 913 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 PI16Q6UXB8 463 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 ALG1Q9BT22 464 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 KRT23Q9C075 422 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 IFNKQ9P0W0 207 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.5□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 H0YIN7 160 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 CBFA2T2O43439 604 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 MAP3K9P80192 1104 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 PKN1Q16512 942 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 LONRF3Q496Y0 759 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 WASF1Q92558 559 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 DPF2Q92785 391 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 CHMP3Q9Y3E7 222 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 STX10O60499 249 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 SYKP43405 635 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 PDE4BQ07343 736 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 TC2NQ8N9U0 490 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 MLKLQ8NB16 471 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 SPATA5Q8NB90 893 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 ROBO3Q96MS0 1386 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 PRELPP51888 382 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 TMTC2Q8N394 836 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 LTBP3Q9NS15 1303 aa9.49□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 ZBTB43O43298 467 aa9.48□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 TADA3O75528 432 aa9.48□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 PHKA1P46020 1223 aa9.48□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.48□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.48□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 PANX2Q96RD6 677 aa9.48□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 BECN2A8MW95 431 aa9.48□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 ARHGAP6O43182 974 aa9.48□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 E2F4Q16254 413 aa9.48□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CACNA1A-210ENST00000590205 TTLL6Q8N841 843 aa9.48□□□□□ -0.89
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