RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.99■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.99■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 NOVP48745 357 aa22.99■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 NFKBIBQ15653 356 aa22.99■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.99■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 HACL1Q9UJ83 578 aa22.99■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.99■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 MTMR6Q9Y217 621 aa22.99■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 DDAH1O94760 285 aa22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 PDCP20941 246 aa22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 PNMA1Q8ND90 353 aa22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 PHKBQ93100 1093 aa22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 CCDC17Q96LX7 622 aa22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 MYH8P13535 1937 aa22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 CALM1P0DP23 149 aa22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 CALM2P0DP24 149 aa22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 CALM3P0DP25 149 aa22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 RASA3Q14644 834 aa22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.97■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 TNNI2P48788 182 aa22.97■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 PPP2R5BQ15173 497 aa22.97■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 CDKL5O76039 1030 aa22.96■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 IFNAR1P17181 557 aa22.96■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.96■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 GRIN3BO60391 1043 aa22.96■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.96■■□□□ 1.27
PGS1-211ENST00000589425 TNFAIP1Q13829 316 aa22.95■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 NBPF11Q86T75 865 aa22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 TEPSINQ96N21 525 aa22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 KIF3AQ9Y496 699 aa22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 GDF11O95390 407 aa22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 FOSBP53539 338 aa22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 JAG1P78504 1218 aa22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.94■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 TBC1D12O60347 775 aa22.93■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 F13A1P00488 732 aa22.93■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 MAP3K14Q99558 947 aa22.93■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.93■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.93■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 TTLL1O95922 423 aa22.92■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 FUT2Q10981 343 aa22.92■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.92■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.92■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 AIFM3Q96NN9 605 aa22.92■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 MTMR7Q9Y216 660 aa22.92■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 GUCY1A2P33402 732 aa22.92■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 MAP3K10Q02779 954 aa22.92■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 SEPT2Q15019 361 aa22.92■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.92■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 H3BQV1 296 aa22.91■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 IFFO2Q5TF58 517 aa22.91■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.91■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.91■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.91■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.91■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 STK36Q9NRP7 1315 aa22.91■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 MCM4P33991 863 aa22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 GUCY1B3Q02153 619 aa22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 NBR1Q14596 966 aa22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 GRM4Q14833 912 aa22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 GBP4Q96PP9 640 aa22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.9■■□□□ 1.26
PGS1-211ENST00000589425 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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