RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588335.1

GRIN3B-202, Transcript of glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3B, humanhuman

TSL 3

Gene GRIN3B, Length 528 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3B-202ENST00000588335 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 FOXP2O15409 715 aa16.08■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 EVX2Q03828 476 aa16.08■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 SKAP1Q86WV1 359 aa16.08■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 SLC44A5Q8NCS7 719 aa16.08■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 CTNNA3Q9UI47 895 aa16.08■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 ANAPC4Q9UJX5 808 aa16.08■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 PHIPQ8WWQ0 1821 aa16.08■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 SPP2Q13103 211 aa16.07■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 BRI3BPQ8WY22 251 aa16.07■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 EFCC1Q9HA90 598 aa16.07■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 C19orf81C9J6K1 198 aa16.06■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 USP17L10C9JJH3 530 aa16.06■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 SGSM2O43147 1006 aa16.06■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 PCP11498 1178 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 EN2P19622 333 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa16.06■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 PTPRFP10586 1907 aa16.06■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 ZNF213O14771 459 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 CDC45O75419 566 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 AKR1B1P15121 316 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 NT5C2P49902 561 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 USP14P54578 494 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 BACE1P56817 501 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 JAG1P78504 1218 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 SP3Q02447 781 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 CRHR2Q13324 411 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 ARHGEF6Q15052 776 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 ANKRD23Q86SG2 305 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 STK11IPQ8N1F8 1099 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 CD99L2Q8TCZ2 262 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 TMEM106CQ9BVX2 250 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 SH2D4AQ9H788 454 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 BRCA2P51587 3418 aa16.04■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 SMIM22K7EJ46 135 aa16.04■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 RASA1P20936 1047 aa16.04■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 SEPT2Q15019 361 aa16.04■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 SH3D19Q5HYK7 790 aa16.04■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa16.04■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 GADL1Q6ZQY3 521 aa16.04■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 NBPF11Q86T75 865 aa16.04■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 FEZ1Q99689 392 aa16.04■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 PTPN18Q99952 460 aa16.04■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.04■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.04■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16.04■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 BTBD19C9JJ37 291 aa16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 PRDM1O75626 825 aa16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 TSPY3P0CV98 308 aa16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 TSPY8P0CW00 308 aa16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 HMGCS2P54868 508 aa16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 ICA1Q05084 483 aa16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 CTDSPL2Q05D32 466 aa16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 MTMR2Q13614 643 aa16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 USP17L2Q6R6M4 530 aa16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 MFSD6Q6ZSS7 791 aa16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 ZNF333Q96JL9 665 aa16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 ORC4O43929 436 aa16.02■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 GUCY1A2P33402 732 aa16.02■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 HAND2P61296 217 aa16.02■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 AKNAD1Q5T1N1 836 aa16.02■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 FAM43AQ8N2R8 423 aa16.02■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa16.02■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 IL25Q9H293 177 aa16.02■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 TOMM22Q9NS69 142 aa16.02■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 PNMA3Q9UL41 463 aa16.02■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
GRIN3B-202ENST00000588335 TSPY2A6NKD2 308 aa16.01■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 PDHXO00330 501 aa16.01■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 FGRP09769 529 aa16.01■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 TFAP4Q01664 338 aa16.01■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 MOGSQ13724 837 aa16.01■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 NEDD1Q8NHV4 660 aa16.01■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 STAG1Q8WVM7 1258 aa16.01■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 LAMA4Q16363 1823 aa16.01■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 PLIN4Q96Q06 1357 aa16■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 CEP290O15078 2479 aa16■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 ATP2B2Q01814 1243 aa16■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 GPAT2Q6NUI2 795 aa16■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 LPAR1Q92633 364 aa16■□□□□ 0.15
GRIN3B-202ENST00000588335 MAP4K1Q92918 833 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms