RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 SLITRK5O94991 958 aa8.56□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 PROCP04070 461 aa8.56□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 CDK5R2Q13319 367 aa8.56□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.56□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 ZAR1Q86SH2 424 aa8.56□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.56□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.56□□□□□ -1.04
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TSG101-211ENST00000580814 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.56□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
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TSG101-211ENST00000580814 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.56□□□□□ -1.04
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TSG101-211ENST00000580814 UBOX5O94941 541 aa8.55□□□□□ -1.04
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TSG101-211ENST00000580814 GBP1P32455 592 aa8.55□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 RAB33AQ14088 237 aa8.55□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 DOC2BQ14184 412 aa8.55□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 PPP2R5EQ16537 467 aa8.55□□□□□ -1.04
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TSG101-211ENST00000580814 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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TSG101-211ENST00000580814 EOMESO95936 686 aa8.54□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 ADMP35318 185 aa8.54□□□□□ -1.04
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TSG101-211ENST00000580814 RIN3Q8TB24 985 aa8.54□□□□□ -1.04
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TSG101-211ENST00000580814 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.54□□□□□ -1.04
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TSG101-211ENST00000580814 ETV3P41162 512 aa8.53□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 CYP27A1Q02318 531 aa8.53□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 FXNQ16595 210 aa8.53□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.53□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.53□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 LEFTY1O75610 366 aa8.52□□□□□ -1.05
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TSG101-211ENST00000580814 NFIAQ12857 509 aa8.52□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 SERINC3Q13530 473 aa8.52□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.52□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 CDH24Q86UP0 819 aa8.52□□□□□ -1.05
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TSG101-211ENST00000580814 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 IGLV1-40P01703 118 aa8.51□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 CYP7A1P22680 504 aa8.51□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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TSG101-211ENST00000580814 DPH6Q7L8W6 267 aa8.51□□□□□ -1.05
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TSG101-211ENST00000580814 FBXL18Q96ME1 805 aa8.51□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 SLC6A18Q96N87 628 aa8.51□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
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TSG101-211ENST00000580814 SHISA5Q8N114 240 aa8.5□□□□□ -1.05
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TSG101-211ENST00000580814 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.5□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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TSG101-211ENST00000580814 DDR2Q16832 855 aa8.49□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.49□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.49□□□□□ -1.05
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TSG101-211ENST00000580814 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.49□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.49□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 ASPNQ9BXN1 380 aa8.49□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.49□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.49□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 FAM170BA6NMN3 283 aa8.48□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 DYRK3O43781 588 aa8.48□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 CHMP4BP1P59074 171 aa8.48□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 RNF4P78317 190 aa8.48□□□□□ -1.05
TSG101-211ENST00000580814 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.48□□□□□ -1.05
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