RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580784.5

CSNK1D-215, Transcript of casein kinase 1 delta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSNK1D, Length 1,081 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1D-215ENST00000580784 SHISA4Q96DD7 197 aa25.67■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 DYNLL2Q96FJ2 89 aa25.67■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.67■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 UNC93B1Q9H1C4 597 aa25.67■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 GJD2Q9UKL4 321 aa25.67■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 PLXNB2O15031 1838 aa25.66■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 INHAP05111 366 aa25.66■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 USP14P54578 494 aa25.66■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 Q3C1V9 767 aa25.66■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.66■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.65■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 SMIM22K7EJ46 135 aa25.65■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 GJA8P48165 433 aa25.65■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.65■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 USP17L15C9J2P7 530 aa25.64■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.64■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 USP17L11C9JVI0 530 aa25.64■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 USP17L18D6R9N7 530 aa25.64■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 USP17L22D6RA61 530 aa25.64■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.64■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 USP17L19D6RCP7 530 aa25.64■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 USP17L20D6RJB6 530 aa25.64■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 USP17L24Q0WX57 530 aa25.64■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 GPATCH3Q96I76 525 aa25.64■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.64■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 SWAP70Q9UH65 585 aa25.64■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.64■■□□□ 1.7
CSNK1D-215ENST00000580784 USP17L12C9JPN9 530 aa25.63■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 USP17L21D6R901 530 aa25.63■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 VCAM1P19320 739 aa25.63■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 C12orf60Q5U649 245 aa25.63■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.63■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 A0A1W2PRG0 241 aa25.62■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 ERVK-9P63128 1117 aa25.62■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 ERVK-24P63145 666 aa25.62■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.62■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 CRBNQ96SW2 442 aa25.61■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 PORCNQ9H237 461 aa25.61■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 SGPL1O95470 568 aa25.6■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 AKR1B1P15121 316 aa25.6■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 CDK8P49336 464 aa25.6■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 CTR9Q6PD62 1173 aa25.6■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.6■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.6■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.6■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 CNMDO75829 334 aa25.59■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 CYP2B6P20813 491 aa25.59■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 MAPK4P31152 587 aa25.59■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 OSBP2Q969R2 916 aa25.59■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 DEFB118Q96PH6 123 aa25.59■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.59■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 CEP290O15078 2479 aa25.58■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 TRIM32Q13049 653 aa25.58■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.58■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.58■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.58■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 NUDT12Q9BQG2 462 aa25.58■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CSNK1D-215ENST00000580784 HMGCRP04035 888 aa25.57■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 GPR142Q7Z601 462 aa25.57■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa25.57■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 APPBP2Q92624 585 aa25.57■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.56■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.56■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 TRIB2Q92519 343 aa25.56■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 CCDC17Q96LX7 622 aa25.56■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 BTBD7Q9P203 1132 aa25.56■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.56■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC34A2O95436 690 aa25.55■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 LBX2Q6XYB7 198 aa25.55■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 PLEKHH3Q7Z736 793 aa25.55■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.55■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 SOCS4Q8WXH5 440 aa25.55■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.683e-9■■■□□ 16.2
CSNK1D-215ENST00000580784 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 ICA1Q05084 483 aa25.54■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 USP6NLQ92738 828 aa25.54■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.54■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 TMX2Q9Y320 296 aa25.54■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 RLFQ13129 1914 aa25.53■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 ERC2O15083 957 aa25.53■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 CCNA1P78396 465 aa25.53■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 COG2Q14746 738 aa25.53■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 MORN1Q5T089 497 aa25.53■■□□□ 1.68
CSNK1D-215ENST00000580784 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms