RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 DNM3Q9UQ16 869 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 VCX3BQ9H321 246 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 A1BGP04217 495 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 BANK1Q8NDB2 785 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 MYCT1Q8N699 235 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 RPS6KA1Q15418 735 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 HSPA1LP34931 641 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 KCNA6P17658 529 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 GCNT3O95395 438 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 ADALQ6DHV7 355 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 HGSO14964 777 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 GGA1Q9UJY5 639 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 USTQ9Y2C2 406 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 FLOT1O75955 427 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 PFKFB1P16118 471 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 CABS1Q96KC9 395 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 ATP5JP18859 108 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 RRAGAQ7L523 313 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 CROCCP2Q86T23 111 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 VPS52Q8N1B4 723 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 BTG4Q9NY30 223 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA0556O60303 1618 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 GCKP35557 465 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF131P52739 623 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 NBPF14Q5TI25 921 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 WDR62O43379 1518 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 ITIH3Q06033 890 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC38Q502W7 563 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 PEX26Q7Z412 305 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
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PTPRM-211ENST00000580170 MTMR3Q13615 1198 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
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PTPRM-211ENST00000580170 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 CRCPO75575 148 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 EXOC3O60645 756 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 GMNNO75496 209 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 ZWINTO95229 277 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF853P0CG23 659 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 GEN1Q17RS7 908 aa23.65■■□□□ 1.38
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PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1468Q9P260 1216 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 USH1GQ495M9 461 aa23.64■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 HHATQ5VTY9 493 aa23.64■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC105Q8IYK2 499 aa23.64■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.64■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
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PTPRM-211ENST00000580170 PTH1RQ03431 593 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 SSH2Q76I76 1423 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 BCRP11274 1271 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 CCT6BQ92526 530 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC51Q96ER9 411 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.64■■□□□ 1.37
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PTPRM-211ENST00000580170 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 RNF34Q969K3 372 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 SLC1A4P43007 532 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 CERS3Q8IU89 383 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 MYO1AQ9UBC5 1043 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 ABCC4O15439 1325 aa23.63■■□□□ 1.37
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PTPRM-211ENST00000580170 SAR1BQ9Y6B6 198 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 VSIG1Q86XK7 387 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 KCNJ18B7U540 433 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 KCNJ12Q14500 433 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PTPRM-211ENST00000580170 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
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