RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-210	ENST00000578916		E9PSI1	815 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-210	ENST00000578916	CNMD	O75829	334 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-210	ENST00000578916	HLA-DOA	P06340	250 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-210	ENST00000578916	CYP2C19	P33261	490 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-210	ENST00000578916	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-210	ENST00000578916	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-210	ENST00000578916	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-210	ENST00000578916	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-210	ENST00000578916	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-210	ENST00000578916	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-210	ENST00000578916	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-210	ENST00000578916	BAD	Q92934	168 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-210	ENST00000578916	FEZ1	Q99689	392 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-210	ENST00000578916	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-210	ENST00000578916	DNAJC18	Q9H819	358 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRM-210	ENST00000578916	FLT1	P17948	1338 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	SRGAP3	O43295	1099 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	HOXC6	P09630	235 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	USP14	P54578	494 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	PPP4C	P60510	307 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	GRB14	Q14449	540 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	C12orf42	Q96LP6	360 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	PALD1	Q9ULE6	856 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	GH2	P01242	217 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	MCAM	P43121	646 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	TRIM60	Q495X7	471 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	DPP9	Q86TI2	863 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	TRPV1	Q8NER1	839 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	MEIS3	Q99687	375 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	CYBA	P13498	195 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	COL9A1	P20849	921 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	ANO1	Q5XXA6	986 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	BTBD7	Q9P203	1132 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	TNFRSF10A	O00220	468 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	SEPT4	O43236	478 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	GNAI3	P08754	354 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	VCAM1	P19320	739 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	SNX17	Q15036	470 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	LBX2	Q6XYB7	198 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	FERMT2	Q96AC1	680 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	STRN	O43815	780 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	ADORA2A	P29274	412 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	SLFN5	Q08AF3	891 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	MTX1	Q13505	466 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	CABP5	Q9NP86	173 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	IGHA2	P01877	340 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	USP5	P45974	858 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	TLE2	Q04725	743 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	LRRC41	Q15345	812 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	ACER1	Q8TDN7	264 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRM-210	ENST00000578916	SIPA1L1	O43166	1804 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-210	ENST00000578916	LTBP2	Q14767	1821 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-210	ENST00000578916	IGSF3	O75054	1194 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-210	ENST00000578916	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-210	ENST00000578916	CLTB	P09497	229 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-210	ENST00000578916	RAG1	P15918	1043 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-210	ENST00000578916	CYP7A1	P22680	504 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-210	ENST00000578916	COG2	Q14746	738 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-210	ENST00000578916	GRIN2C	Q14957	1233 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRM-210	ENST00000578916	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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