RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAPK4P31152 587 aa34.15■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LCORLQ8N3X6 602 aa34.15■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ACER1Q8TDN7 264 aa34.15■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SDR42E1Q8WUS8 393 aa34.15■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SOCS4Q8WXH5 440 aa34.15■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa34.15■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP17L15C9J2P7 530 aa34.14■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP17L13C9JLJ4 530 aa34.14■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP17L11C9JVI0 530 aa34.14■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP17L18D6R9N7 530 aa34.14■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP17L22D6RA61 530 aa34.14■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP17L17D6RBQ6 530 aa34.14■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP17L19D6RCP7 530 aa34.14■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP17L20D6RJB6 530 aa34.14■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP17L24Q0WX57 530 aa34.14■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRIM32Q13049 653 aa34.14■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PDE3AQ14432 1141 aa34.14■■■■□ 3.06
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 Q3C1V9 767 aa34.14■■■■□ 3.06
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C20orf194Q5TEA3 1177 aa34.13■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PORCNQ9H237 461 aa34.13■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ATP5JP18859 108 aa34.12■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CHRDL2Q6WN34 429 aa34.12■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARMT1Q9H993 441 aa34.12■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa34.12■■■■□ 3.05
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SEPT2Q15019 361 aa34.11■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 POTEEQ6S8J3 1075 aa34.11■■■■□ 3.05
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GUCY1A2P33402 732 aa34.1■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ADD2P35612 726 aa34.1■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP34.1■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLFNL1Q499Z3 407 aa34.1■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa34.1■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GPR142Q7Z601 462 aa34.1■■■■□ 3.05
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP34.1■■■■□ 3.05
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LRRCC1Q9C099 1032 aa34.09■■■■□ 3.05
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CNMDO75829 334 aa34.06■■■■□ 3.04
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ANKLE1Q8NAG6 615 aa34.05■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP6NLQ92738 828 aa34.05■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SWAP70Q9UH65 585 aa34.05■■■■□ 3.04
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DYNLL2Q96FJ2 89 aa34.04■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa34.04■■■■□ 3.04
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 APBA2Q99767 749 aa34.03■■■■□ 3.04
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 A0A1W2PRG0 241 aa34.02■■■■□ 3.04
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CHGBP05060 677 aa34.02■■■■□ 3.04
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LBX2Q6XYB7 198 aa34.02■■■■□ 3.04
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UBE3CQ15386 1083 aa34.01■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AMOTL1Q8IY63 956 aa34.01■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BTBD7Q9P203 1132 aa34.01■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAP2K5Q13163 448 aa34■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa34■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DDRGK1Q96HY6 314 aa34■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ALPK3Q96L96 1907 aa33.99■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TANGO6Q9C0B7 1094 aa33.99■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NBPF3Q9H094 633 aa33.99■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OGDHLQ9ULD0 1010 aa33.99■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa33.98■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AKR1B1P15121 316 aa33.98■■■■□ 3.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa33.98■■■■□ 3.03
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