RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM17	Q9Y577	477 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	EYS	Q5T1H1	3165 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	NR3C2	P08235	984 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	ERVK-9	P63128	1117 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	KIFC2	Q96AC6	838 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	RUNDC1	Q96C34	613 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	WNK4	Q96J92	1243 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	CYLD	Q9NQC7	956 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	JAG2	Q9Y219	1238 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PTPRM-206	ENST00000578093	CACNA1F	O60840	1977 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	MGAM	O43451	1857 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	CLRN2	A0PK11	232 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	NF2	P35240	595 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	GTF2I	P78347	998 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	CRHR2	Q13324	411 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	MAP3K11	Q16584	847 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	G2E3	Q7L622	706 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	TSPYL6	Q8N831	410 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPN18	Q99952	460 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	COA1	Q9GZY4	146 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPRF	P10586	1907 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093		F8W031	263 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	TIMP2	P16035	220 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	RASA1	P20936	1047 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	CASP7	P55210	303 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	PDE4C	Q08493	712 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	OGFOD1	Q8N543	542 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	HPS1	Q92902	700 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	ARMC5	Q96C12	935 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	GCC1	Q96CN9	775 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF333	Q96JL9	665 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	IFT57	Q9NWB7	429 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	VCAN	P13611	3396 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	DOCK2	Q92608	1830 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM196B	A6NMK8	535 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	APAF1	O14727	1248 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	TAF5L	O75529	589 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	UPP2	O95045	317 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	ITGA6	P23229	1130 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	CHRND	Q07001	517 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	RALBP1	Q15311	655 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	CFAP100	Q494V2	611 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	SHISA4	Q96DD7	197 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	ITPKC	Q96DU7	683 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	ERO1A	Q96HE7	468 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	ELP3	Q9H9T3	547 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	EFCC1	Q9HA90	598 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	VEZT	Q9HBM0	779 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	CD209	Q9NNX6	404 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	USP17L15	C9J2P7	530 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	USP17L10	C9JJH3	530 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	USP17L12	C9JPN9	530 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPRM-206	ENST00000578093	USP17L11	C9JVI0	530 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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