RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576557.1

ABCC1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 1, humanhuman

TSL 4

Gene ABCC1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1-208ENST00000576557 DEFB123Q8N688 67 aa14.95□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 USP17L15C9J2P7 530 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 USP17L11C9JVI0 530 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 USP17L18D6R9N7 530 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 USP17L22D6RA61 530 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 USP17L19D6RCP7 530 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 USP17L20D6RJB6 530 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 CNMDO75829 334 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 COL6A1P12109 1028 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 USP17L24Q0WX57 530 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 MAP2K5Q13163 448 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 TDHQ8IZJ6 230 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 ACER1Q8TDN7 264 aa14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 APBA2Q99767 749 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.93□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 C12orf42Q96LP6 360 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 BTBD7Q9P203 1132 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 A0A0C4DFX4 3053 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 COL6A3P12111 3177 aa14.91□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 VCAM1P19320 739 aa14.91□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 CNGA1P29973 690 aa14.91□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 CCNA1P78396 465 aa14.91□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.91□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 GPR153Q6NV75 609 aa14.91□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 TTC6Q86TZ1 520 aa14.91□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.91□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.91□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 IGSF3O75054 1194 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 PTPREP23469 700 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 CYP2C19P33261 490 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 PLCD1P51178 756 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 USP14P54578 494 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 ATP2B2Q01814 1243 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 MAP3K12Q12852 859 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 EHD4Q9H223 541 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 CABP5Q9NP86 173 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCC1-208ENST00000576557 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 RLBP1P12271 317 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 SHMT1P34896 483 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 EVX2Q03828 476 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 SEPT2Q15019 361 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 AACSQ86V21 672 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 FRMPD3Q5JV73 1810 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 GUCY1A2P33402 732 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 CERS3Q8IU89 383 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 TRPV1Q8NER1 839 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 GRB14Q14449 540 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 ANO1Q5XXA6 986 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 CEP85Q6P2H3 762 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 PANK1Q8TE04 598 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 BCL11AQ9H165 835 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 A0A1W2PRG0 241 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 HOXC6P09630 235 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 CYP2D6P10635 497 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 MS4A1P11836 297 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 LBX2Q6XYB7 198 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 DPP9Q86TI2 863 aa14.86□□□□□ -0.03
ABCC1-208ENST00000576557 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.9 ms