RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570051.5

RNPS1-226, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 735 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-226ENST00000570051 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.65■■□□□ 1.54
RNPS1-226ENST00000570051 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.65■■□□□ 1.54
RNPS1-226ENST00000570051 RASA1P20936 1047 aa24.64■■□□□ 1.54
RNPS1-226ENST00000570051 PPARAQ07869 468 aa24.64■■□□□ 1.54
RNPS1-226ENST00000570051 ALX1Q15699 326 aa24.64■■□□□ 1.54
RNPS1-226ENST00000570051 C17orf99Q6UX52 265 aa24.64■■□□□ 1.54
RNPS1-226ENST00000570051 FEZ1Q99689 392 aa24.64■■□□□ 1.54
RNPS1-226ENST00000570051 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.64■■□□□ 1.54
RNPS1-226ENST00000570051 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.63■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 ERO1AQ96HE7 468 aa24.63■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 C12orf42Q96LP6 360 aa24.63■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.63■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.63■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.533e-8■■□□□ 11.4
RNPS1-226ENST00000570051 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.62■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.62■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.62■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 CPA4Q9UI42 421 aa24.62■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 PNMA3Q9UL41 463 aa24.62■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 ZMYM6O95789 1325 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 A0A1W2PRG0 241 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 USP14P54578 494 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 CAP1Q01518 475 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 ICA1Q05084 483 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 SKAP1Q86WV1 359 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.61■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 PRDM1O75626 825 aa24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 FGAP02671 866 aa24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 BCRP11274 1271 aa24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 PDE4BQ07343 736 aa24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 IL25Q9H293 177 aa24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 OSBPP22059 807 aa24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-226ENST00000570051 VCAM1P19320 739 aa24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 CHMLP26374 656 aa24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 TMX2Q9Y320 296 aa24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 TRIM17Q9Y577 477 aa24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 RAD50Q92878 1312 aa24.57■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 SH2D4AQ9H788 454 aa24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 LAMA4Q16363 1823 aa24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.55■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.55■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.55■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.55■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 EFCC1Q9HA90 598 aa24.55■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 KIF22Q14807 665 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 ABHD8Q96I13 439 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 INCENPQ9NQS7 918 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 HTTP42858 3142 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 USP17L15C9J2P7 530 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 USP17L11C9JVI0 530 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 USP17L18D6R9N7 530 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 USP17L22D6RA61 530 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 USP17L19D6RCP7 530 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 USP17L20D6RJB6 530 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 FGRP09769 529 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 CTGFP29279 349 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 HERVK_113P62684 666 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 ATP2B2Q01814 1243 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 USP17L24Q0WX57 530 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 NBPF3Q9H094 633 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 VCPKMTQ9H867 229 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 MGAMO43451 1857 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 ORC4O43929 436 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 TSPY3P0CV98 308 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 TSPY8P0CW00 308 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 HAND2P61296 217 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 ARHGEF6Q15052 776 aa24.52■■□□□ 1.52
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