RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 PDE4BQ07343 736 aa26.58■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 SERTAD1Q9UHV2 236 aa26.58■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.58■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 POSTNQ15063 836 aa26.57■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.57■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 TMC6Q7Z403 805 aa26.57■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 CSRNP2Q9H175 543 aa26.57■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 CNBD1Q8NA66 436 aa26.56■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.56■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.56■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.56■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 USP17L8P0C7I0 530 aa26.56■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 TNFRSF25Q93038 417 aa26.56■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 LDHBP07195 334 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 ATP1A3P13637 1013 aa26.55■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 BMP6P22004 513 aa26.55■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 NPY5RQ15761 445 aa26.55■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.55■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 MAN1B1Q9UKM7 699 aa26.55■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 TSPY2A6NKD2 308 aa26.55■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 PRR29P0C7W0 189 aa26.55■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 TNNT1P13805 278 aa26.55■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 XDHP47989 1333 aa26.54■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 IGSF3O75054 1194 aa26.54■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 NT5DC1Q5TFE4 455 aa26.54■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 RCSD1Q6JBY9 416 aa26.54■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 USP49Q70CQ1 688 aa26.54■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 CCDC150Q8NCX0 1101 aa26.54■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 PDCL3Q9H2J4 239 aa26.54■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 C12orf60Q5U649 245 aa26.53■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 TSC1Q92574 1164 aa26.53■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.53■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 USP27XA6NNY8 438 aa26.53■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.53■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 USP5P45974 858 aa26.52■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 SARSP49591 514 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 ARMCX5Q6P1M9 558 aa26.52■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.52■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 PDILTQ8N807 584 aa26.52■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
EHD4-202ENST00000569223 WNT7AO00755 349 aa26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 MYO1BO43795 1136 aa26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 BMP15O95972 392 aa26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 KANK3Q6NY19 840 aa26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 SMARCE1Q969G3 411 aa26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 MAP7D2Q96T17 732 aa26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 SCG2P13521 617 aa26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 GSTO1P78417 241 aa26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 GRIK5Q16478 980 aa26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 KCND1Q9NSA2 647 aa26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 ROBO3Q96MS0 1386 aa26.51■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 CBFA2T2O43439 604 aa26.5■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 MORC3Q14149 939 aa26.5■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 DPF2Q92785 391 aa26.5■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.5■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 UBASH3AP57075 661 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 TFAP4Q01664 338 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 TTC38Q5R3I4 469 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 FERMT2Q96AC1 680 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 FANCLQ9NW38 375 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 SERPINC1P01008 464 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 ADRA2BP18089 450 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 KIF5BP33176 963 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 NT5C2P49902 561 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 ZNF174Q15697 407 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 KAT14Q9H8E8 782 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 IL17RBQ9NRM6 502 aa26.49■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 A0A087X0B3 334 aa26.48■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 PPP4CP60510 307 aa26.48■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 GPSM2P81274 684 aa26.48■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.48■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 MLKLQ8NB16 471 aa26.48■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.48■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 BAG3O95817 575 aa26.48■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 NYAP1Q6ZVC0 841 aa26.48■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 DGKHQ86XP1 1220 aa26.48■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 ANKS1AQ92625 1134 aa26.48■■□□□ 1.83
EHD4-202ENST00000569223 EPSTI1Q96J88 318 aa26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms