RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568631.5

RNPS1-223, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-223	ENST00000568631	DDAH1	O94760	285 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	NOV	P48745	357 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	MYH8	P13535	1937 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	NID2	Q14112	1375 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	SCN4A	P35499	1836 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	WDR90	Q96KV7	1748 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	PPP2R5B	Q15173	497 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	MYL10	Q9BUA6	226 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	CABP5	Q9NP86	173 aa		18.91	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	DCAF15	Q66K64	600 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	SULF1	Q8IWU6	871 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		18.9	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
RNPS1-223	ENST00000568631	CPLX1	O14810	134 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	TTLL1	O95922	423 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	RXRA	P19793	462 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	DDIT3	P35638	169 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	TROAP	Q12815	778 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	FANCB	Q8NB91	859 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		18.89	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	POTEC	B2RU33	542 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	GDF11	O95390	407 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	RTN1	Q16799	776 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	PNMA1	Q8ND90	353 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	CDKL5	O76039	1030 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	MAP3K14	Q99558	947 aa		18.88	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	GH2	P01242	217 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	GJB2	P29033	226 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		18.87	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	CTDNEP1	O95476	244 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	CDC27	P30260	824 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	CAP2	P40123	477 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	SEPT2	Q15019	361 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	NYAP2	Q9P242	653 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	KIF5B	P33176	963 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	GUCY1A2	P33402	732 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	ICA1	Q05084	483 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	GINM1	Q9NU53	330 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		18.86	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	JAK2	O60674	1132 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	MKL1	Q969V6	931 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	KIF3A	Q9Y496	699 aa		18.85	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	ASNS	P08243	561 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	JAG1	P78504	1218 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	ATP2B2	Q01814	1243 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		18.84	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	ADM5	C9JUS6	153 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	PDC	P20941	246 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	NUCB2	P80303	420 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	GRM4	Q14833	912 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	NTRK3	Q16288	839 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		18.83	■□□□□ 0.61
RNPS1-223	ENST00000568631	IFNAR1	P17181	557 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	GNAQ	P50148	359 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	DDX11	Q96FC9	970 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	RRAGC	Q9HB90	399 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RNPS1-223	ENST00000568631	USP48	Q86UV5	1035 aa		18.82	■□□□□ 0.6

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