RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567843.1

GTF3C1-208, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C1, Length 474 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-208ENST00000567843 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 DEFB118Q96PH6 123 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 GJD2Q9UKL4 321 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 MGAMO43451 1857 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 GJA8P48165 433 aa14.74□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.74□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.74□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 PORCNQ9H237 461 aa14.74□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.74□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 A0A1W2PRG0 241 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 USP17L15C9J2P7 530 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 USP17L12C9JPN9 530 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 USP17L11C9JVI0 530 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 USP17L21D6R901 530 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 USP17L18D6R9N7 530 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 USP17L22D6RA61 530 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 USP17L19D6RCP7 530 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 USP17L20D6RJB6 530 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 AKR1B1P15121 316 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 VCAM1P19320 739 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 USP17L24Q0WX57 530 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 UBE3CQ15386 1083 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 CNMDO75829 334 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 SLC34A2O95436 690 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 SGPL1O95470 568 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 USP14P54578 494 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 RRP1P56182 461 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 ERVK-9P63128 1117 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 ERVK-24P63145 666 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 WDR78Q5VTH9 848 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 DPF3Q92784 378 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 C12orf42Q96LP6 360 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 CRBNQ96SW2 442 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 CDK8P49336 464 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 ATP2B2Q01814 1243 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 C12orf60Q5U649 245 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 TRIB2Q92519 343 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 GPATCH3Q96I76 525 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C1-208ENST00000567843 H0YGN5 161 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 HMGCRP04035 888 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 CCL14Q16627 93 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 CTR9Q6PD62 1173 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 GPR142Q7Z601 462 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 OSBP2Q969R2 916 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 BTBD7Q9P203 1132 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 SWAP70Q9UH65 585 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 MAPK4P31152 587 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 M0R2C6 588 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 ICA1Q05084 483 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 RAD21O60216 631 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 APPP05067 770 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GTF3C1-208ENST00000567843 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms