RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF208	Q9H0X6	261 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	HTT	P42858	3142 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	ELN	P15502	786 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	CDK8	P49336	464 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479		Q3C1V9	767 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	CTR9	Q6PD62	1173 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	GJD2	Q9UKL4	321 aa		11.29	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	SIPA1L1	O43166	1804 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	GJB1	P08034	283 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	VCAM1	P19320	739 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	GJA8	P48165	433 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	ERVK-9	P63128	1117 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	ERVK-24	P63145	666 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	APPBP2	Q92624	585 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	OSBP2	Q969R2	916 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		11.28	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1W2PRG0	241 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	PEX10	O60683	326 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	INHA	P05111	366 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	AKR1B1	P15121	316 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	MAPK4	P31152	587 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	AAMP	Q13685	434 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	SBK1	Q52WX2	424 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		11.27	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM22	K7EJ46	135 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	GPAA1	O43292	621 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	SGPL1	O95470	568 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	APP	P05067	770 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	CAPN2	P17655	700 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	GNAT2	P19087	354 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	MX1	P20591	662 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP2B6	P20813	491 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	CCNA1	P78396	465 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	COG2	Q14746	738 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	LBX2	Q6XYB7	198 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	PORCN	Q9H237	461 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	SH2D4A	Q9H788	454 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	TMX2	Q9Y320	296 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	MYH1	P12882	1939 aa		11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	PTPRF	P10586	1907 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	CENPF	P49454	3210 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	CNMD	O75829	334 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	HMGCR	P04035	888 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	ICA1	Q05084	483 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR142	Q7Z601	462 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	LPAR1	Q92633	364 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	SHISA4	Q96DD7	197 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	DEFB118	Q96PH6	123 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	FSD1	Q9BTV5	496 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		11.25	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479		M0R2C6	588 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	TDO2	P48775	406 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP2B2	Q01814	1243 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR78	Q5VTH9	848 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KIFC3-231	ENST00000567479	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		11.24	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms