RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-208ENST00000564966 USP17L19D6RCP7 530 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-208ENST00000564966 USP17L20D6RJB6 530 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-208ENST00000564966 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-208ENST00000564966 SGPL1O95470 568 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-208ENST00000564966 CYP2B6P20813 491 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-208ENST00000564966 USP17L24Q0WX57 530 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-208ENST00000564966 AMOTL1Q8IY63 956 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-208ENST00000564966 ACER1Q8TDN7 264 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-208ENST00000564966 DDRGK1Q96HY6 314 aa30.58■■■□□ 2.49
PPP4C-208ENST00000564966 HMGCRP04035 888 aa30.57■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 CYP2D6P10635 497 aa30.57■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 ERVK-9P63128 1117 aa30.57■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 ERVK-24P63145 666 aa30.57■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 EVX2Q03828 476 aa30.57■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 SEPT2Q15019 361 aa30.57■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 HTATIP2Q9BUP3 242 aa30.57■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 RBPJLQ9UBG7 517 aa30.57■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 PRKAB2O43741 272 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 NUDT12Q9BQG2 462 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa30.56■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 MAPK4P31152 587 aa30.55■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 GPATCH3Q96I76 525 aa30.55■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 C12orf42Q96LP6 360 aa30.55■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 GJD2Q9UKL4 321 aa30.55■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 H0YGN5 161 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 VCAM1P19320 739 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 GABPAQ06546 454 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 WDR78Q5VTH9 848 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 DYNLL2Q96FJ2 89 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP30.54■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa30.54■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 CHGBP05060 677 aa30.53■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 Q3C1V9 767 aa30.53■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 SLC44A5Q8NCS7 719 aa30.53■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 SOCS4Q8WXH5 440 aa30.53■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 ECHDC1Q9NTX5 307 aa30.53■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 SWAP70Q9UH65 585 aa30.53■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa30.53■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa30.52■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 PORCNQ9H237 461 aa30.52■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
PPP4C-208ENST00000564966 GUCY1A2P33402 732 aa30.51■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 CCNA1P78396 465 aa30.51■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 TRIM32Q13049 653 aa30.51■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 UBE3CQ15386 1083 aa30.51■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 PLEKHH3Q7Z736 793 aa30.51■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 GPR142Q7Z601 462 aa30.5■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa30.5■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa30.49■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 TMEM179Q6ZVK1 233 aa30.49■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 TRIB2Q92519 343 aa30.49■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 TANGO6Q9C0B7 1094 aa30.49■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 DCTPP1Q9H773 170 aa30.49■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 RPTORQ8N122 1335 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 MYH7P12883 1935 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 USP17L12C9JPN9 530 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 USP17L21D6R901 530 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 RGS2P41220 211 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 TSHZ3Q63HK5 1081 aa30.48■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 MYH8P13535 1937 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa30.47■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 PLXNB2O15031 1838 aa30.46■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 AKR1B1P15121 316 aa30.46■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 CAPN2P17655 700 aa30.46■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 ATP2B2Q01814 1243 aa30.46■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
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PPP4C-208ENST00000564966 NR2E3Q9Y5X4 410 aa30.46■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 CEP290O15078 2479 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 A0A1W2PRG0 241 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 CNMDO75829 334 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 ICA1Q05084 483 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 C12orf60Q5U649 245 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 POTEEQ6S8J3 1075 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 CLEC10AQ8IUN9 316 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 SH2D4AQ9H788 454 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa30.45■■■□□ 2.47
PPP4C-208ENST00000564966 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 CDK8P49336 464 aa30.44■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa30.44■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 NECAB2Q7Z6G3 386 aa30.43■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 APBA2Q99767 749 aa30.43■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 BTBD7Q9P203 1132 aa30.43■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 SMIM22K7EJ46 135 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 RAD21O60216 631 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 EVI5O60447 810 aa30.42■■■□□ 2.46
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