RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556591.1

CFAP54-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 54, human

TSL 5

Gene CFAP54, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP54-208	ENST00000556591	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	MSMP	Q1L6U9	139 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	TINF2	Q9BSI4	451 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	CBX7	O95931	251 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	GBP1	P32455	592 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	RGS13	O14921	159 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	UBOX5	O94941	541 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	CEACAM5	P06731	702 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	IMPDH2	P12268	514 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	ETV3	P41162	512 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	LRP8	Q14114	963 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	NETO1	Q8TDF5	533 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	ACR	P10323	421 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	SPINK2	P20155	84 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	CYP7A1	P22680	504 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	VPS37D	Q86XT2	251 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	DTX1	Q86Y01	620 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	CRBN	Q96SW2	442 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC9A7	Q96T83	725 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
CFAP54-208	ENST00000556591	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	ADAMTS4	O75173	837 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	LRRN2	O75325	713 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	ARTN	Q5T4W7	220 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	TNFRSF10C	O14798	259 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	BNIP3	Q12983	259 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	MFSD4A	Q8N468	514 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	SHD	Q96IW2	340 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591		Q96M66	194 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	GIPR	P48546	466 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	TNK2	Q07912	1038 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM192	Q8IY95	271 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	RNF141	Q8WVD5	230 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	VWCE	Q96DN2	955 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	TM9SF2	Q99805	663 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	GUCY2C	P25092	1073 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	CD96	P40200	585 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	CHMP4BP1	P59074	171 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	ARID5A	Q03989	594 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	AOC3	Q16853	763 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC6A18	Q96N87	628 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	7.43	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	7.43	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	CCNF	P41002	786 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	KIR3DL1	P43629	444 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591		Q8N3U1	123 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CFAP54-208	ENST00000556591	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22

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